快速有效的方法来跟踪COVID-19传播的未经处理的废水
![Methods used to recover MHV in this study. The most successful was method (C), followed by method (B) (Warish Ahmed et al., Science of The Total Environment, June 5, 2020). Credit: Warish Ahmed et al., Science of The Total Environment, June 5, 2020 快速有效的方法来跟踪COVID-19传播的未经处理的废水](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2020/aquickcostef.jpg)
跟踪COVID-19流行病的传播目前鼻拭子或唾液样本进行测试。工具和技术来追踪流行病的传播通过其他方式将是非常有益的;废水监测方法,允许我们监视流行病的传播规模更大。这并不是一项新技术,用于检测非包膜病毒,但传统方法对于包膜病毒如SARS-CoV-2尚未开发。
在当前的工作,由助理教授的渡边Kitajima水质北海道大学控制工程实验室,科学家报告一种快速、经济的方法集中在未经处理的冠状病毒废水。鼠肝炎病毒(MHV),一种包膜病毒,SARS-CoV-2密切相关但不影响人类,因此安全用于测试该方法的可行性。该研究发表在科学的环境。
科学家获得MHV老鼠粪便,介绍了样本的未经处理的废水收集到布里斯班,澳大利亚。他们试图恢复,从这些样本集中MHV七种不同的方法,通常用来测试无包膜病毒。恢复MHV的数量被称为反向transcription-quantitative PCR的方法,确定病毒的RNA提取,转化成DNA, DNA是多次重复,增加数量的DNA是在整个过程中测量。
经济复苏是最高的方法,涉及治疗样本氯化镁然后过滤带负电的病毒膜;第二个最高的复苏是通过类似的方法氯化镁。这些方法的优点包括初始处理时间在1小时和便宜,只需要广泛使用设备和试剂。也有缺点,如过滤器的堵塞可能会增加处理时间。然而,到目前为止,需要反向transcription-qPCR病毒的检测是不可避免的。
下一步将是测试这种方法收集的样本中,来自的地方流感大流行普遍存在。有两个目的:一是表明,这项技术可以用于SARS-CoV-2,另一个是显示测试可用于样本外的实验室。
“我希望这一研究有助于建立一个标准协议的检测SARS-CoV-2在废水中,“Kitajima助理教授说,“这反过来加速COVID-19流行病学调查,加强我们的理解通过废水监测。”He is currently involved in a number of studies related to applying wastewater-based epidemiology to tracking the spread of the COVID-19 pandemic, and has collaborated with a number of scientists and research groups across the world in this endeavor.
更多信息:Warish艾哈迈德et al。病毒浓度的比较方法RT-qPCR-based复苏鼠肝炎病毒,代孕SARS-CoV-2从未经处理的废水,科学的环境(2020)。DOI: 10.1016 / j.scitotenv.2020.139960