快速有效的方法来跟踪COVID-19传播的未经处理的废水
跟踪COVID-19流行病的传播目前鼻拭子或唾液样本进行测试。工具和技术来追踪流行病的传播通过其他方式将是非常有益的;废水监测方法,允许我们监视流行病的传播规模更大。这并不是一项新技术,用于检测非包膜病毒,但传统方法对于包膜病毒如SARS-CoV-2尚未开发。
在当前的工作,由助理教授的渡边Kitajima水质北海道大学控制工程实验室,科学家报告一种快速、经济的方法集中在未经处理的冠状病毒废水。鼠肝炎病毒(MHV),一种包膜病毒,SARS-CoV-2密切相关但不影响人类,因此安全用于测试该方法的可行性。该研究发表在科学的环境。
科学家获得MHV老鼠粪便,介绍了样本的未经处理的废水收集到布里斯班,澳大利亚。他们试图恢复,从这些样本集中MHV七种不同的方法,通常用来测试无包膜病毒。恢复MHV的数量被称为反向transcription-quantitative PCR的方法,确定病毒的RNA提取,转化成DNA, DNA是多次重复,增加数量的DNA是在整个过程中测量。
经济复苏是最高的方法,涉及治疗样本氯化镁然后过滤带负电的病毒膜;第二个最高的复苏是通过类似的方法氯化镁。这些方法的优点包括初始处理时间在1小时和便宜,只需要广泛使用设备和试剂。也有缺点,如过滤器的堵塞可能会增加处理时间。然而,到目前为止,需要反向transcription-qPCR病毒的检测是不可避免的。
下一步将是测试这种方法收集的样本中,来自的地方流感大流行普遍存在。有两个目的:一是表明,这项技术可以用于SARS-CoV-2,另一个是显示测试可用于样本外的实验室。
“我希望这一研究有助于建立一个标准协议的检测SARS-CoV-2在废水中,“Kitajima助理教授说,“这反过来加速COVID-19流行病学调查,加强我们的理解通过废水监测。”He is currently involved in a number of studies related to applying wastewater-based epidemiology to tracking the spread of the COVID-19 pandemic, and has collaborated with a number of scientists and research groups across the world in this endeavor.
更多信息:Warish艾哈迈德et al。病毒浓度的比较方法RT-qPCR-based复苏鼠肝炎病毒,代孕SARS-CoV-2从未经处理的废水,科学的环境(2020)。DOI: 10.1016 / j.scitotenv.2020.139960