新工具比COVID-19病毒疫苗开发

墨尔本的研究人员已经开发出一种工具来监控突变,很难发展冠状病毒(COVID-19)疫苗和药物。

确保治疗是有效的病毒变异研究是一个巨大的挑战。利用基因组和强大的新工具蛋白质关于病毒和它的信息突变辅助药物和疫苗的发展。

墨尔本大学副教授大卫·亚瑟和他的团队Bio21分子科学与生物技术研究所和贝克心脏和糖尿病研究所开发了软件工具和图书馆,被称为COVID-3-D。

发表在自然遗传学COVID-3-D包含所有的蛋白质结构信息,配合SARS-CoV-2 (COVID-19)基因组,包括所有已知基因突变及其合成突变体蛋白质结构。

“尽管SARS-CoV-2病毒是一种相对较新的病原体,容易积累在其基因突变的能力从一开始就明显的大流行,”亚瑟副教授说。

”治疗药物设计和发现的背景下,这些突变,和他们积累的模式在病毒的蛋白质结构,可以影响疫苗和药物的能力来绑定病毒,或创建一个特定的免疫反应。正因为如此,科学家必须不仅试图控制病毒,但它比通过预测它将如何随时间变化。”

几家国际大学和研究机构已经在使用COVID-3-D疫苗和治疗的发展。

”Bio21正在使用它作为持续努力的一部分,理解和开发药物来治疗COVID-19,”亚瑟副教授说。

开发COVID-3-D,亚瑟教授的团队分析了超过120000的基因组测序数据SARS-CoV-2全球感染人的样本,包括那些澳大利亚独特的影响,来确定突变在每个病毒的蛋白质。测试和分析了突变的影响他们使用计算机模拟蛋白质结构。

这个数据被用来计算所有生物基因组内的每一个可能的突变的影响。帮助研究人员占未来可能的突变,研究小组分析了突变相关冠状病毒冠和蝙蝠RaTG13。

突变或生物体遗传物质的变化是自然的“错误”细胞的复制过程。他们可以给病毒新的“权力”的生存、传染性和毒性。幸运的是,研究人员发现SARS-CoV-2比其他病毒如流感变异较慢,大约每个月两个新基因的变化。

COVID-3-D可以帮助研究人员识别突变如何操作和确定更有效的疫苗和药物靶点。

“只有当你知道如何突变会影响蛋白质的三维形状,你可以预测是否会损害你的药物结合的能力,”亚瑟副教授说。

“随着全球科学和医学社区收益更好的理解背后的生物学SARS-CoV2感染和疾病,这将是一个强大的资源预测问题与突变和指导发展的更有效的治疗方法。COVID-3-D继续更新新的蛋白质结构,突变和分析突变导致的问题和增加我们的理解疾病的SARS-CoV-2机制。”