1990年代的阿根廷发现霍乱疫情
流行病和地方病的进化到了细菌的菌株霍乱弧菌在阿根廷详细映射了威康基金会桑格研究所的研究人员,伦敦卫生和热带医学学院,剑桥大学和INEI-ANLIS卡洛斯·g·Malbran博士的阿根廷。团队使用了全基因组测序研究细菌循环在1991 - 1998年爆发的霍乱。
数据有影响卫生政策在阿根廷,现在全国警报监测系统使用全基因组测序来区分流感大流行和non-pandemic血统霍乱弧菌细菌。这项研究发表在自然通讯今天。
霍乱菌株引起的霍乱弧菌细菌,目前影响全球47个国家,每年近100000人的生命。自1800年代以来,全球已经有七个霍乱大流行,造成数百万人死亡。当前的流行,它开始于1960年代,是由一个血统的霍乱弧菌7的宠物。而拉丁美洲南部和中部在很大程度上恢复海地暴发始于2010年,家族继续传播全球,是世界上最大的霍乱疫情的原因,持续在也门,成千上万的受感染。
在一项新的研究中,研究小组的基因组测序一组独特的历史霍乱弧菌样本,INEI-ANLIS举行“卡洛斯·g . Malbran博士”,阿根廷的国家参考实验室。由re-analyzing过去,国际研究小组的研究人员希望更好地理解疾病的未来模式,并支持快速警报的新介绍流行的血统。
他们使用系统发育分析,证实1992年阿根廷爆发霍乱是由一个引入7宠物霍乱弧菌细菌,最初引入秘鲁。然后细菌进化很少在六年的流行。这是与多样化,多种流行株霍乱弧菌同时传播。之前的工作的团队表明,虽然流行菌株可以让人生病,他们似乎缺乏潜力迅速传播并导致流行病。
马修·多尔曼威康基金会桑格研究所的这项研究的第一作者说:“当一个7宠物流行毒株进入拉丁美洲从别处,它可能导致大规模的流行,比如在秘鲁在1990年代和2010年海地。如果我们要有效地控制霍乱流行,至关重要的是,我们能够区分和理解当地之间的差异,流行霍乱弧菌霍乱疫情期间,共存与7宠物。我们的研究阐述了这两种类型的基因组进化历史在一个国家,在一个十年,是本地区主要的霍乱暴发。”
公共卫生当局使用的结果已经在阿根廷,在全国警报系统已经更改为区分流行7宠物的血统和地方霍乱弧菌使用全基因组测序血统。
Josefina坎波斯博士,资深作者从INEI-ANLIS”卡洛斯·g·Malbran博士”,布宜诺斯艾利斯,阿根廷说:“由于一个全面的监测和报告系统,参考实验室在阿根廷包含整个的快照流行。这给了我们一个独特的机会,了解详细的进化霍乱弧菌细菌在我们国家。我们将能够使用这些数据和经验告诉我们如何监控和应对未来任何霍乱outbreaks-bacteria导致流行病对那些不构成不同的风险;这是简单的信息,疾病控制是至关重要的。我们是世界上第一个国家报告系统使用基因组数据监控霍乱这样的。”
尼克•汤姆森教授威康基金会桑格研究所的资深作者,伦敦卫生和热带医学学院的说:“这样详细的研究有助于我们了解霍乱是如何移动全球:证据告知改进控制策略以及识别领域进一步的研究。我们面临的挑战是为了更好地理解为什么这样一个简单的细菌继续这样的威胁人类健康,与本研究我们是小小的一步。”
更多信息:马修·j·多尔曼等人的基因组学阿根廷霍乱疫情阐明流行的对比动态和流行霍乱弧菌,自然通讯(2020)。DOI: 10.1038 / s41467 - 020 - 18647 - 7