“多媒体”将新细胞添加到免疫家谱

“多媒体”将新细胞添加到免疫家谱
澳大利亚研究人员使用了强大的“单细胞多摩斯”技术来发现以前未知的T和B淋巴细胞(如图),这是我们免疫系统的关键组成部分。学分:澳大利亚韦希

WEHI研究人员使用了功能强大的“单细胞多词素”技术来发现以前未知的T和B淋巴细胞的祖先,这是我们免疫系统的关键组成部分。

研究人员使用类似于运动队的表现达到单个球员统计数据的方法,研究人员研究了单个发育中的免疫细胞的多个方面,以定义哪种细胞只会引起T和B。这揭示了一个新的舞台,可以丰富免疫系统的未来研究的信息。该发现还带来了新的研究机会,WEHI在2018年建立了澳大利亚首次专用和集成的单细胞研究平台之一,该平台现在用于解决其他研究问题。

该研究发表在自然免疫学今天,由Shalin Naik博士,Daniela Zalcenstein博士,Luyi Tian先生,Jaring Schreuder先生和Sara Tomei女士领导。

专注于单细胞

我们的免疫系统包括许多具有不同功能的不同类型的细胞,但所有免疫细胞均来自单一类型的细胞,即血干细胞。不同的免疫细胞类型的发展是通过未成熟细胞的分支“家谱”发生的。在免疫细胞发育的较早阶段,单个细胞会引起几种不同类型的成熟细胞,但是随着发育的进展,细胞变得更加有限,可以产生最终成熟细胞。

Naik博士说,T和B淋巴细胞对于靶向,特定的免疫反应至关重要,是密切相关的免疫细胞,这意味着它们在发育中有许多共同的步骤。他说:“数十年的研究已经定义了T和B淋巴细胞的发展方式,并且当发育细胞失去发展为其他免疫细胞类型的能力时,其家谱中的'分支点'。”

Zalcenstein博士说,为了获得有关免疫细胞如何发展的问题的新见解,该团队建立了澳大利亚的第一个“单细胞多派杂志”平台,现在可以在单元开放研究中的所有研究人员中使用该平台,该平台已建立。Naik博士和Zalcenstein博士与Wehi基因组中心的Stephen Wilcox博士和Matthew Ritchie副教授合作。

“多词技术结合了不同的生物学数据集(例如基因组学,转录组学和蛋白质组学),以比查看一个数据集更详细地比较不同的样本。我们已经将这种方法应用于研究单个细胞,在这种情况下,开发了开发单个细胞免疫细胞,更详细地了解哪些细胞可以引起淋巴细胞。这种方法称为单细胞多词。”她说。

“与其查看样本中许多单元格的数据,我们专注于单个单元格,以了解较大人群中存在的差异。这就像看足球队一样,您可以平均找出目标,铲球和铲球的数量和她说:“但是,如果您查看单个玩家统计数据,您可能会发现一个球员攻入了很多进球,而另一个球员则负责大多数铲球。”

新的淋巴细胞祖细胞

Score对免疫细胞前体的研究表明,先前未识别的细胞类型可能引起T和B淋巴细胞,但没有其他

Naik博士说:“该细胞在淋巴细胞发育中比我们怀疑的要早得多。”“以前的技术已经将不同的免疫祖细胞分组在一起,但是通过研究各个细胞,我们能够鉴定出一种致力于发展为T和B淋巴细胞的细胞类型。”

该发现为T和B淋巴细胞的家族树增加了一层,并可以推动其他研究领域。

“更详细地理解T和B淋巴细胞如何发展可能导致更好的方法来再生这些方法奈克博士说,作为某些疾病的治疗方法。我们还知道,在免疫细胞发育的早期阶段,许多类型的白血病引起了许多类型的白血病,因此我们很想知道该祖细胞是否与任何形式的白血病有联系。”

Zalcenstein博士说,这项研究是单细胞多词的力量的一个很好的例子。“至少四十年来对淋巴细胞开发进行了深入研究。即使这样,通过采用这种新方法,我们能够了解更多信息。这是Score解决的第一个项目之一,从那时起,我们已经应用了同样的方法解决了100多个不同的研究问题。这是一个非常令人兴奋的新领域,这是一部分的一部分。”她说。


进一步探索

研究探讨了代谢在免疫细胞行为中的作用

更多信息:由单细胞多词确定的DACH1下调标记的新型淋巴酸化的祖细胞,自然免疫学(2020)。doi:10.1038/s41590-020-0799-x,,,,www.nature.com/articles/s41590-020-0799-x
期刊信息: 自然免疫学

引用:“多摩斯”将新细胞添加到免疫家庭树(2020年10月19日)2021年5月29日从//www.pyrotek-europe.com/news/2020-10-multi-omics-cell-mmmune-family-tree检索。html
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