“多媒体”将新细胞添加到免疫家谱
WEHI研究人员使用了功能强大的“单细胞多词素”技术来发现以前未知的T和B淋巴细胞的祖先,这是我们免疫系统的关键组成部分。
研究人员使用类似于运动队的表现达到单个球员统计数据的方法,研究人员研究了单个发育中的免疫细胞的多个方面,以定义哪种细胞只会引起T和B淋巴细胞。这揭示了一个新的舞台淋巴细胞发育,可以丰富免疫系统的未来研究的信息。该发现还带来了新的研究机会,WEHI在2018年建立了澳大利亚首次专用和集成的单细胞研究平台之一,该平台现在用于解决其他研究问题。
该研究发表在自然免疫学今天,由Shalin Naik博士,Daniela Zalcenstein博士,Luyi Tian先生,Jaring Schreuder先生和Sara Tomei女士领导。
专注于单细胞
我们的免疫系统包括许多具有不同功能的不同类型的细胞,但所有免疫细胞均来自单一类型的细胞,即血干细胞。不同的免疫细胞类型的发展是通过未成熟细胞的分支“家谱”发生的。在免疫细胞发育的较早阶段,单个细胞会引起几种不同类型的成熟细胞,但是随着发育的进展,细胞变得更加有限,可以产生最终成熟细胞。
Naik博士说,T和B淋巴细胞对于靶向,特定的免疫反应至关重要,是密切相关的免疫细胞,这意味着它们在发育中有许多共同的步骤。他说:“数十年的研究已经定义了T和B淋巴细胞的发展方式,并且当发育细胞失去发展为其他免疫细胞类型的能力时,其家谱中的'分支点'。”
Zalcenstein博士说,为了获得有关免疫细胞如何发展的问题的新见解,该团队建立了澳大利亚的第一个“单细胞多派杂志”平台,现在可以在单元开放研究中的所有研究人员中使用该平台,该平台已建立。Naik博士和Zalcenstein博士与Wehi基因组中心的Stephen Wilcox博士和Matthew Ritchie副教授合作。
“多词技术结合了不同的生物学数据集(例如基因组学,转录组学和蛋白质组学),以比查看一个数据集更详细地比较不同的样本。我们已经将这种方法应用于研究单个细胞,在这种情况下,开发了开发单个细胞免疫细胞,更详细地了解哪些细胞可以引起淋巴细胞。这种方法称为单细胞多词。”她说。
“与其查看样本中许多单元格的数据,我们专注于单个单元格,以了解较大人群中存在的差异。这就像看足球队一样,您可以平均找出目标,铲球和铲球的数量和她说:“但是,如果您查看单个玩家统计数据,您可能会发现一个球员攻入了很多进球,而另一个球员则负责大多数铲球。”
新的淋巴细胞祖细胞
Score对免疫细胞前体的研究表明,先前未识别的细胞类型可能引起T和B淋巴细胞,但没有其他免疫细胞。
Naik博士说:“该细胞在淋巴细胞发育中比我们怀疑的要早得多。”“以前的技术已经将不同的免疫祖细胞分组在一起,但是通过研究各个细胞,我们能够鉴定出一种致力于发展为T和B淋巴细胞的细胞类型。”
该发现为T和B淋巴细胞的家族树增加了一层,并可以推动其他研究领域。
“更详细地理解T和B淋巴细胞如何发展可能导致更好的方法来再生这些方法细胞奈克博士说,作为某些疾病的治疗方法。我们还知道,在免疫细胞发育的早期阶段,许多类型的白血病引起了许多类型的白血病,因此我们很想知道该祖细胞是否与任何形式的白血病有联系。”
Zalcenstein博士说,这项研究是单细胞多词的力量的一个很好的例子。“至少四十年来对淋巴细胞开发进行了深入研究。即使这样,通过采用这种新方法,我们能够了解更多信息。这是Score解决的第一个项目之一,从那时起,我们已经应用了同样的方法解决了100多个不同的研究问题。这是一个非常令人兴奋的新领域,这是一部分的一部分。”她说。
进一步探索
用户评论