2020年夏天，一种新型SARS-CoV-2变种在欧洲蔓延
根据本周发布的一份未经同行评审的预印本，来自巴塞尔和西班牙的研究人员发现了近几个月来在欧洲广泛传播的一种新型SARS-CoV-2变体。虽然没有证据表明这种变异更危险，但它的传播可能会让人们对欧洲国家在夏季采取的旅行政策的有效性有所了解。
仅在欧洲，就有数百种不同的新冠状病毒SARS-CoV-2目前正在传播，区别在于其基因组的突变。然而，这些变种中只有极少数能像新发现的变种20A.EU1那样成功传播并流行开来。
巴塞尔大学ETH Zürich和SeqCOVID-Spain联盟的研究人员分析和比较了从欧洲各地COVID-19患者收集的病毒基因组序列，以追踪病原体的进化和传播(见方框)。他们的分析表明，这种变异在夏季起源于西班牙。这种新变种的最早证据与西班牙东北部农业工人之间的一次超级传播事件有关。这种变异传播到当地人群中，迅速在全国范围内扩展，现在几乎占了来自西班牙的序列的80%。
该研究的第一作者、巴塞尔大学的艾玛·霍德克罗夫特博士强调说:“值得注意的是，目前没有证据表明新变种的传播是由于增加传播或影响临床结果的突变所致。”研究人员认为，夏季放松旅行限制和保持社交距离的措施促进了这种变异的传播。
与西班牙的春天相似
该论文的合著者、seqcovid -西班牙联盟的负责人Iñaki Comas教授建议说:“我们在西班牙的这种变异中看到了与我们在春天看到的相似的模式。”“在最初的超级传播事件的帮助下，一种变体可以迅速在全国流行起来。”
从公元20A年7月开始。随着欧洲各国边境的开放，EU1带着旅行者一起移动，现在已经在12个欧洲国家得到确认。它还从欧洲传播到香港和新西兰。虽然最初的变种可能直接从西班牙传入，但变种可能随后继续从次要国家传播。
目前,20。EU1占英国90%的序列，占爱尔兰60%的序列，占瑞士和荷兰30% - 40%的序列。这使得这种变种目前在欧洲最普遍。法国、比利时、德国、意大利、拉脱维亚、挪威和瑞典也发现了这种病毒。
旅行促进了病毒的传播
基因分析表明，这种变异在欧洲国家之间至少传播了几十次，甚至可能数百次。“我们可以看到，病毒已经在几个国家被多次引入，其中许多已经在人群中传播，”ETH Zürich的塔尼亚·施塔德勒教授说，他是该研究的主要研究员之一。“这并不是一次引入就成功的情况。”
尽管20A的患病率在上升。EU1与今年秋季在许多欧洲国家观察到的病例数量增加相吻合，该研究的作者警告说，不要把新的变异解释为病例增加的原因。“这不是最近几周和几个月里传播的唯一变体，”巴塞尔大学的理查德·内赫教授说，他是这项研究的主要研究员之一。“事实上，在一些COVID-19病例显著增加的国家，如比利时和法国，其他变体很普遍。”
对西班牙夏季SARS-CoV-2流行率和旅游数据的分析表明，这些因素可能解释了20A。EU1传播得如此成功。西班牙相对较高的病例数和作为度假目的地的受欢迎程度可能为传播提供了多种机会，其中一些可能在回国后通过危险行为发展成更大的疫情。
该研究的作者强调了评估边境控制和旅行限制在控制夏季SARS-CoV-2传播方面的作用以及旅行所发挥的作用的重要性。“长期的边境关闭和严重的旅行限制并不可行，也不可取，”霍德克罗夫特解释说，“而是来自20A的扩散。显然，目前的措施往往不足以阻止今年夏天引入的变种的继续传播。当各国努力将SARS-CoV-2病例减少到较低数量时，找到在不增加病例风险的情况下‘开放’的更好方法至关重要。”
评估新变种的表型
Hodcroft在使用“Nextstrain”平台对瑞士序列进行分析时首次发现了这种新的变异，该平台由巴塞尔大学和华盛顿州西雅图的Fred Hutchinson癌症研究中心联合开发。EU1的特征是改变病毒刺突、核衣壳和ORF14蛋白中的氨基酸的突变。
虽然目前的知识状态不表明20A。EU1的传播是由于传播能力的变化，作者目前正在与病毒学实验室合作，研究被称为S:A222V的刺突突变可能对新冠病毒的表型产生的任何潜在影响。他们还希望很快就能获得数据，使他们能够评估这种变异的临床意义。
此外，该研究的作者强调了监测像20A这样的新变体的崛起的重要性。Neher补充说:“只有通过对病毒基因组进行测序，我们才能在新的SARS-CoV-2变体出现时识别出它们，并监测它们在国家内部和国家之间的传播。但我们拥有的序列数量在国家之间差异很大，通过在欧洲各地更快和更定期的测序工作，我们可能能够更快地识别出上升的变体。”
