纽约市的冠状病毒疫情传播比首次报道更多欧洲来源
COVID-19大流行比我们原先认为的要早开始在纽约和长岛数十人感染主要来自欧洲。一项新的分析还表明,大多数是在社区内传播,而不是来自旅行的人。
先前的测试在3月3日发现了第一个病例的病毒感染爆炸前整个市区,导致260600年5月中旬阳性病例。
格罗斯曼由纽约大学医学院的研究人员所使用的新研究基因测试跟踪SARS-CoV-2的起源,大流行性流感病毒在春天,在纽约地区。它表明,病毒首先扎根在2月底,播种至少109个不同的来源,冲进连锁店的感染,而不是从一个“病人零。”
值得注意的是,该研究的作者说,超过40%的人没有已知阳性接触另一个感染者在感染了病毒。
“我们的发现表明,纽约的早期筛选试验方法错过了发病和爆发的根源几天至少,”说研究位联席作者马修·Maurano博士病理学系的助理教授在纽约大学Langone健康。“工作强烈表明,未来爆发扼杀在摇篮里,我们需要一个系统的快速、充足的实时监测以及传统遗传流行病学指标。”
研究人员还发现,超过95%的纽约人COVID-19与突变的病毒毒株可能更容易传播给他人。Maurano说,这一发现有助于解释为什么在纽约的病毒传播如此咄咄逼人,即使占这个城市的人口密度高。
在基因测序,研究人员比较小片段的遗传密码识别突变只发现在一个特定的病毒毒株。这些“旗帜”,Maurano说,然后可以用来跟踪如何应变传播随着时间的推移,类似于测试用于跟踪血统的人。专家曾使用这种技术跟随流感疫情,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA),和埃博拉病毒等感染。
这项新的研究,发表在《华尔街日报》10月22日基因组研究,是迄今为止最大的努力跟踪COVID-19流行使用基因测序,根据Maurano。
在这项研究中,研究人员收集了864病毒遗传信息鼻拭子从纽约人COVID-19阳性3月12日和5月10日之间。大多数人来自曼哈顿,布鲁克林,拿骚县在长岛。然后,研究人员比较了病毒的基因序列从这些样本的原始菌株分离去年冬天从病人在武汉,中国,大流行性流感被认为已经开始。
这项研究表明,病毒的基因编码在纽约更紧密地匹配的菌株从欧洲或美国其他州而不是来自中国,病毒源自哪里。此外,一些早期的链感染人跑至少50人长。
“我们的基因测序技术允许我们评估我们的筛选试验的精度,“高级研究作者阿德里安娜Heguy说,博士,纽约大学Langone病理学系的教授。“基于这些结果,很明显,我们需要一个系统的丰富的测试,提供快速的结果。”
她指出,序列分析研究中仅占10%的COVID-19患者在一个医院系统在纽约。社区感染的真正规模因此可能更高,和最初的介绍病毒到纽约可能是早些时候。
Heguy说,小组下一步计划调查发现的突变基因检测是否可以影响冠状病毒在其他方面,如造成新的COVID-19或更严重的症状。
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