洛杉矶儿童医院进行最大的儿科基因组COVID-19迄今为止的研究
关于儿童,很明显,Covid-19对他们的影响比最初意识到的更大。然而,关于小儿种群中引起疾病的病毒SARS-COV-2的信息相对较少。洛杉矶儿童医院的科学家刚刚出版了最大的儿科Covid-19研究迄今为止,首次提出特定病毒突变与疾病严重程度之间的可能联系。
Covid-19不是遗传疾病,而是SARS-COV-2病毒的遗传学在其扩散中起重要作用。突变 - 病毒基因组中复制的基因组中的突变会影响病毒传播的方式,并可能在疾病的严重程度中发挥作用。了解这些联系对于与这一大流行作斗争至关重要。
“ SARS-COV-2在遗传上是不稳定的,”洛杉矶儿童医院生物信息学主任Xiaowu Gai说。“我们倾向于指'病毒',但是当我们考虑病毒基因组时,它不是一种静态的单一病毒,而是实际上是感染患者中所有病毒的遗传变化的集合。”
但是,根据盖伊博士的说法,大多数SARS-COV-2病毒经历的突变是微不足道的,甚至可能削弱它,但某些突变可能会改变大流行的过程。例如,在该病毒的尖峰蛋白中,称为D614G的突变可能有助于人与人之间的可传播性提高。在大流行开始时,D614G突变代表了SARS-COV-2样品的一小部分,但此后增加了这一版本的病毒接管。
Gai博士说,现在,他们序列的几乎每个样本都有这种突变。他说:“我们不知道的是这种突变和其他突变是否会影响该疾病的严重程度。”“这就是我们试图找出的东西。”并且有充分的理由 - 如果医生可以预测哪些患者更可能患有严重疾病,则可以更快地进行救生治疗。
但是很少遗传研究发表,当了解病毒如何影响儿童时,数据甚至更薄。“对于SARS-COV-2,实际上缺乏儿科基因组研究。”詹妮弗·迪恩·贝德(Jennifer Dien Bard),博士,洛杉矶儿童医院临床微生物学和病毒学实验室主任。“我们正在努力改变这一点。”
博士。Gai和Dien Bard曾在病理和实验室医学系的一个多学科团队中工作,以遗传对他们收到的每个COVID-19阳性样本进行遗传顺序,使CHLA处于儿科病毒基因组研究的最前沿。他们的努力导致迄今为SARS-COV-2发布的临床相关儿科基因组数据收集最多。除了对样品进行测序外,科学家还研究了病毒(称为进化枝)的亚组如何对儿童有不同的影响。
迪恩·巴德(Dien Bard)博士说:“这项研究非常独特,因为除了拥有大量的基因组数据之外,我们确实在研究这一切的含义:我们如何追踪这种病毒?基因组学如何相关有了临床结果吗?这些研究还没有出去,因此我们正在努力满足需求。”
从研究中出现的趋势之一是一定的分组突变在最严重的COVID-19症状的患者中,称为20C进化枝20C。这项研究是第一个检查这些潜在联系的研究。
盖伊博士说:“将需要更大的研究确认一个SARS-COV-2亚组会导致预后较差,但这项研究是一个明显的例子,强调了检查研究遗传学的重要性。病毒。这些是拼图,可以帮助我们领先这个大流行。”