SARS-CoV-2突变似乎没有增加传播能力

根据伦敦大学学院的研究人员领导的一项研究，目前记录在SARS-CoV-2病毒中的突变似乎没有增加其在人类中的传播能力。

对来自99个国家的4.6万多名COVID-19患者的病毒基因组的分析于今天发表在自然通讯。

第一作者、通讯作者露西·范·多普博士(伦敦大学学院遗传学研究所)说:“用于科学研究的新冠病毒基因组的数量是惊人的。我们在大流行早期就意识到，我们需要新的方法来分析大量数据，接近实时，以标记新的突变可能影响其传播或症状严重程度的病毒。

“幸运的是，我们发现这些突变都没有使COVID-19传播得更快，但我们需要保持警惕，继续监测新的突变，特别是在疫苗推出之际。”

像SARS-CoV-2这样的冠状病毒是一种RNA病毒，它们都可以通过三种不同的方式发生突变:病毒复制期间的复制错误导致的错误，通过与感染同一细胞的其他病毒的相互作用(重组或重组)，或者它们可以被宿主免疫的一部分宿主RNA修饰系统诱导(例如，一个人自己的免疫系统)。

大多数突变是中性的，而其他突变可能对病毒有利也可能有害。中性和有利突变在传给后代病毒时都可能变得更加常见。

来自伦敦大学学院、Cirad、Université de la Réunion和牛津大学的研究团队分析了截至2020年7月底收集的46723名COVID-19患者的全球病毒基因组数据集。

到目前为止，研究人员已经在导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒中发现了12706个突变。有强有力的证据表明，其中398个突变是反复独立发生的。其中，研究人员重点研究了185个突变，这些突变在大流行期间至少独立发生过三次。

为了测试突变是否会增加病毒的传播，研究人员模拟了病毒的进化树，并分析了特定的突变是否在特定的分支中变得越来越普遍进化树也就是说，测试在病毒首次发生突变后，该病毒的后代是否比没有该特定突变的密切相关的SARS-CoV-2病毒表现更好。

研究人员没有发现任何证据表明常见的突变增加了病毒的传播能力相反，他们发现这种病毒的大多数常见突变是中性的。这包括一种名为D614G的病毒刺突蛋白突变，据广泛报道，这是一种常见的突变，可能会使病毒更具传染性。新的证据发现，这种突变实际上与显著增加的传播无关。

研究人员发现，大多数常见的突变似乎是由人类免疫系统诱导的，而不是病毒适应其新的人类宿主的结果。这一情况与该团队对SARS-CoV-2后来从人类感染到养殖水貂的情况进行的另一项分析形成了对比。

范·多普博士说:“当我们分析来自水貂的病毒基因组时，我们惊讶地发现，相同的突变反复出现在不同的水貂养殖场，尽管这些相同的突变以前很少在人类身上观察到。”

主要作者弗朗索瓦·巴oux教授(伦敦大学学院遗传学研究所)补充说:“我们很可能错过了病毒在人类中的早期适应期。我们此前估计，SARS-CoV-2是在2019年10月或11月感染人类的，但我们掌握的第一批基因组要追溯到12月底。到那时，对人类传播至关重要的病毒突变可能已经出现并变得固定，使我们无法研究它们。”

我们只能预期，随着病毒在人类中变得越来越普遍，它会发生变异，最终分化成不同的谱系，但这并不一定意味着会出现任何更具传染性或更有害的谱系。

范·多普博士说:“这种病毒似乎很适合在人类之间传播，在被确定为一种新型病毒时，它可能已经在人类宿主中达到了最佳适应度。”

这组科学家警告说，即将推出的疫苗可能会对病毒施加新的选择性压力，以逃避人类免疫系统的识别。这可能导致疫苗逃逸突变体的出现。该团队强调，他们开发的计算框架应该被证明对及时识别可能的疫苗逃逸突变是有用的。

巴oux教授总结道:“疫苗方面的消息看起来不错。的病毒在未来很可能会获得疫苗逃逸突变，但我们有信心能够及时标记它们，这将允许在需要时及时更新疫苗。”

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