新的虚拟筛选策略确定了抑制Covid-19病毒的现有药物

新的虚拟筛选策略确定了抑制Covid-19病毒的现有药物
从患者样本中分离的凋亡细胞(粉红色)严重感染SARS-COV-2病毒颗粒(绿色)的彩色扫描电子显微镜图。图片拍摄于马里兰州德特里克堡的NIAID综合研究设施(IRF)。Credit: National Institute of Allergy and Infectious Diseases/NIH, 2020 (CC0)

一种结合实验室实验的新型计算药物筛选策略表明,最初开发用于治疗淋巴瘤的化疗药物普拉雷酯可能被重新用于治疗Covid-19。中国深圳先进技术研究院的张海平及其同事在开放获取期刊上发表了这些发现PLOS计算生物学

随着Covid-19大流行在全球造成疾病和死亡,迫切需要更好的治疗。一个捷径可能是重新利用现有的药物,这些药物原本是用来治疗其他疾病的。通过模拟不同药物与导致Covid-19的SARS-CoV-2病毒的相互作用,计算方法可以帮助识别这些药物。

为了帮助现有药物的虚拟筛选,Zhang和他的同事们结合了多种模拟计算技术-从不同的、互补的角度进行病毒交互。他们使用这种混合方法筛选了1906种现有的药物,它们通过靶向一种名为RNA依赖RNA聚合酶(RdRP)的病毒蛋白来抑制SARS-CoV-2的复制。

这种新的筛选方法确定了四种有希望的药物,然后在实验室中对这些药物进行了针对SARS-CoV-2的测试。其中两种药物,普拉雷酯和阿奇霉素,成功地抑制了病毒的复制。进一步的实验室实验表明,pralatreate的抑制作用更强比目前用于治疗部分Covid-19患者的瑞德西韦更有效。

这些发现表明,普拉雷酯有可能被重新用于治疗Covid-19。然而,该化疗药物可能产生显著的副作用,用于终末期淋巴瘤患者,因此不能保证立即用于Covid-19患者。尽管如此,这些发现支持使用新的筛选策略来识别可以被重新利用的药物。

“我们已经证明了我们的新型混合方法的价值,它将深度学习技术与更传统的分子动力学模拟相结合,”张说。他和他的同事们现在正在开发另外一种生成新的分子结构,这些分子结构可开发成治疗Covid-19的新药。


进一步探索

临床组蛋白去乙酰化酶抑制剂对COVID-19有效

更多信息:Zhang H, Yang Y, Li J, Wang M, Saravanan KM, Wei J, et al.(2020)一种新的虚拟筛选方法确定了pralatreate作为SARS-CoV-2 RdRp抑制剂,并减少了病毒的体外复制。公共科学图书馆第一版杂志16 (12): e1008489。DOI: 10.1371 / journal.pcbi.1008489
期刊信息: PLoS计算生物学

引用:新的虚拟筛选策略确定了抑制Covid-19病毒的现有药物(2020年,12月31日),2021年5月12日从//www.pyrotek-europe.com/news/2020-12-virtual-screening-strategy-drug-inhibits.html检索
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