新的研究表明更好地诊断癌症

新的研究表明更好地诊断癌症
散点图显示了通过传统和Chalm方法计算的差异表达和差分甲基化之间的相关性。信用:宇宙医学院

一位加州新大学,Irvine-LED研究发现了一种识别生物标志物可能有助于早期癌症诊断的新方法。该研究专注于肺癌,然而,细胞异质性调节的克隆甲基化(Chalm)方法也已经过老化和阿尔茨海默氏症的疾病,并预计将有效地研究其他疾病。

“我们发现Chalm方法可能是一个在帮助研究人员中,从基于序列的甲基化数据鉴定更可靠的差异甲基化基因,“魏莉,博士,富丽,议会议员在UCI医学院生物化学系生物信息学教授。“对于临床医生,这种方法可能有助于通过帮助他们识别更多有用的生物标志物,这些生物标志物被传统方法忽略。“

出版于自然通信,该研究标题为“细胞异质性调节的克隆甲基化(Chalm)改善了预测“说明当计算DNA甲基化水平从测序数据时考虑细胞异质性的重要性。

“将Chalm方法应用于A数据集,我们能够识别更可靠和生物功能相关的差异甲基化基因。施用我们的Chalm方法可能导致更好的早期癌症检测,“李说。

使用传统方法来鉴定癌症生物标志物,研究人员一直发现基因表达和启动子甲基化之间的相关性弱,特别是对于低甲基化基因。这项新的研究发现Chalm方法允许更可靠地鉴定不能通过传统方法检测的甲基化标记。


进一步探索

DNA甲基化的生物标志物可以是乳腺癌风险的预测因子

更多信息:细胞异质性调整后克隆甲基化(Chalm)改善了基因表达的预测,自然通信(2021)。DOI:10.1038 / S41467-020-20492-7
信息信息: 自然通信

由...提供加州大学欧文
引文:新的研究表明癌症更好的诊断(2021年,1月27日)从HTTPS://medicalXpress.com/news/2021-01-diagnostics-cancer.html中检索到2021年5月3日
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