研究人员简化了基因环境相互作用的研究
威尔康奈尔医学和康奈尔大学的伊萨卡校园的研究人员已经开发了一种研究遗传和环境相互作用的新计算方法以及它们如何影响疾病风险。
该研究,1月7日出版美国人类遗传学杂志,使这些相互作用的过程减少困难,并表明他们在确定体重指数和糖尿病风险方面的重要性。
“我们的研究表明,您的基因和环境问题以及两者的相互作用可以增加疾病风险,”奥利维尔元素博士奥利维尔·埃尔·埃尔·埃尔博士表示,他们是计算生理医学教授的计算基因组学教授。和生物物理学,HRH Prince Alwaleed Bin Abdulaziziziz Alsaud计算生物医学研究所,以及Caryl和Israel Englander董事威尔康奈尔医学院的精密医学研究所。
通常,研究基因 - 环境互动创造了巨大的计算挑战,威尔康奈尔研究生院的博士候选人表示,其研究博士在纽约市和安德鲁·克拉克博士的研究中进行了研究。实验室在伊萨卡,使他能够立即获得计算生物学和人口健康专业知识。
“基因型 - 环境相互作用可以被认为是某些基因型对环境侮辱更敏感的情况,”克拉克,联合高级作者和雅各布·古尔德·苏格尔曼群体分子生物学部的人口遗传教授说,克拉克博士说艺术学院的遗传学以及康奈尔大学的南希和彼得梅因家庭调查员。“这些是饮食或其他暴露的变化可能具有健康的最大改善的情况,而是仅适用于个人的子集。”
数百万遗传变异,或继承遗传差异在人口中的个人之间发现,以及不同的生活方式和环境因素如吸烟,锻炼,不同的饮食习惯,可以在多种方式中分析组合效果。当研究人员测试基因环境相互作用时,它们通常以成对方式分析数百万个数据点,这意味着它们一次评估一个遗传变异及其与一个环境因子的相互作用。Mardersein表示,这种类型的分析可以变得相当劳动密集型。
新的计算方法优先考虑并评估基因组中的较少数量的变体 - 或在体内 - 基因环境相互作用中发现的一组完整的遗传物质。“我们在分析了1000万不同遗传变异的情况下,在基本上分析了基因组不同地区的几十个变种的问题,”我们仍然凝结了一个问题。“Mardersein说。
虽然标准的遗传结合研究可能会看一种单一遗传变异是否可能导致体重指数(BMI)的平均变化,但该研究评估了哪种遗传变异与更容易具有更高的BMI或低级BMI的个体相关的遗传变异。研究人员发现,寻找与人类特征的差异相关的DNA部分,称为方差定量性状轨迹或VQT1,使其能够更容易识别基因环境相互作用。值得注意的是,与体重指数相关的VQTL也更可能与具有大环境影响的疾病相关。
新的计算方法可能有用的另一个研究领域是确定个人如何应对基于基因环境相互作用的特定药物的响应,说麦克斯坦。健康的社会决定因素分析,意思是一个人的环境和社会条件,如贫困程度和教育程度根据Euremento博士的说法,是研究人员在追求中有趣的第三个领域。
总体而言,精密医学领域的科学家正在实现它们可以序列,除了评估环境因素的空气质量和身体活动之外,还可以更好地了解个体是否有发展特定疾病的风险。“这个线路的想法是在诊所使用这些概念,”博士博士说。“这是精密医学演变的一部分,我们现在可以很容易地序列某人的基因组,然后潜在地分析与发展特定条件的风险相关的遗传景观中的所有变体。”
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