基因 - 映射冠军冰岛在Covid测序中引导了道路
冰岛在大流行开始以来的所有阳性Covid-19案件中,这是一个越来越重要的做法,因为令人担忧的新菌株从英国和南非出现。
周五世界卫生组织敦促所有国家加快基因组测序,以帮助打击新兴变体。
冰岛生物野蛮的科学家解码雷克雅未克的实验室在过去的10个月内致力于努力,分析每个阳性新冠病毒在该国的要求下在冰岛进行测试卫生当局。
目的是追踪每种情况,以防止有问题的是滑过网的。
“这需要我们比较短的时间来做实际测序,”解释实验室的头部奥拉弗·雷莫松,添加“大约三个小时”是确定病毒菌株所需的一切。
整个过程,从将DNA分离到测序它,最多可能需要一天半,并使冰岛能够识别463个单独的变体 - 科学家称之为单倍型。
在测序之前,首先分离每个样品的DNA,然后使用磁珠纯化。
然后将样品充满装备的巨大,明亮的房间,其中震耳声从类似扫描仪的小机器散发出来。
该机器是映射新型冠状病毒基因组的基因序列。
世界领导者
在每台机器内部是一个称为“流动单元”的黑匣子,含有DNA分子的玻璃载玻片。
自大流行开始以来,这项技术在冰岛发挥了重要作用。
“样本的排序是帮助我们遵循流行病的国家和发展的关键,”卫生部长Svandis Svavarsdottir告诉法新社。
她说,当局使用了测序信息来决定精确,有针对性的措施来抑制病毒的传播。
虽然冰岛未在冰岛检测到南非别人,但41人被确定为英国变体的载体。
所有这些都在边境停止 - 在旅行者上进行PCR测试,有效地防止了亚曲率岛上的变体的传动。
DNA识别还使得可以在9月中期的雷克雅未克中部和新浪风中的大多数感染之间建立一个明确的联系,该浪潮领先的当局在首都关闭酒吧和夜总会。
测序还确定了来自两个法国游客的单独菌株,他们在抵达冰岛测试积极的游客,并且初步被指控 - 误认为是9月激增的原因。
冰岛报告的大约6,000个Covid-19案件中所有的所有案例都被测序,使其成为Covid测序的世界领导者。
虽然有几个国家,如英国,丹麦,澳大利亚和新西兰,但均有高水平的测序,但在冰岛的水平附近,虽然全球统计数据不完整,但他们都没有任何地方。
孩子的戏剧
那么为什么冰岛到目前为止在比赛中?
基因映射是解码的专业。
公司成立于1996年,该公司开展了对人口最大的遗传学研究。
对于2015年癌症风险因素的研究,它测量了2,500名冰淇淋的全部基因组,研究了330,000人群中的三分之一的遗传概况。
与此相比,测序Covid-19样本是儿童的戏剧。
“序列是非常容易序列这种病毒基因组:它只是30,000个核苷酸,它没有,”Quips Kari Stefansson,这家71岁的创始人和首席执行官。
相比之下,他的实验室通常分析的人类基因组由34亿对核苷酸或有机分子组成,他补充说。
虽然冰岛的严格测序对于跟踪病毒的传播有用,但它尚未导致任何用于解码的主要科学发现。
“如果病毒与各种模式突变的病毒之间存在差异,它们并不是很明显。我们对我们来说不够明显,”Stefansson说。
©2021 AFP.
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