应对感染治疗更好的理解由于新技术

传染病是由致病性病毒、细菌、真菌和寄生虫。细菌和真菌感染的治疗尤其依赖抗菌药物,而集中在治疗病毒感染症状的减轻。

最初的治疗感染通过临床表现往往是经验和指导。对病原体的功效,然而,只有很少的理解在治疗开始。虽然方法评估治疗反应存在,有效性主要是通过监测感染的症状与体征。

测序技术的进步使得基因组和基因表达产品的特性越来越实用。这项技术也就使得人们有可能鉴别微生物群物种,能够组件。然而,微生物群测序只是偶尔用于感染治疗。

赫尔辛基大学的研究人员,在赫尔辛基大学医院和他们的合作者一起,开发了一种新的sequencing-based病原体从挑战性的样本中发现的方法。使用的方法和初步结果烧伤伤口感染间隙评估已发表在《临床微生物学和感染。

”的方法使捕获实时功能活动甚至极小的数量的微生物。它可以用来可靠地研究微生物耐药机制和其他微生物的活动机制相关的感染及其治疗。这有助于理解致病微生物是否活着或死亡,他们所做的,”说bioinformatician马蒂·Kankainen,博士,赫尔辛基大学的。

技术揭示了病原体的活动

这项技术的基本原理如下:临床样本取自病人及其RNA提取潜在的生物过程的基础,。接下来,微生物RNA纯度来放大病原体的信息。核糖核酸测序,获得的大量的数据分析了新颖的算法。

理解的价值的方法临床实践,研究人员他们的解决方案应用于一个复杂的伤口感染情况。研究主题是伤口感染的病人,治疗了几个抗生素治疗失败几乎一百天。尽管治疗,感染复发。简要第四抗生素疗法开始后,研究人员收集的样本感染的网站。使用他们的方法以及样本分析的帮助下16 s DNA-gene分析更为普遍。从控制主体也相应的样本收集。

第四个抗生素疗法被证明是有效和缓解症状。使用新方法得到的结果同意的临床表现,并证实消除病原体。此外,他们展示了复苏的正常微生物群。一个类似的微生物群在16 s分析未见变化。相反,候选人病原体感染,由于DNA的缓慢分解。

Metatranscriptomics诊断传染病可能的答案

使用的方法称为metatranscriptomics。它允许全面的微生物基因活性测定。它的使用已经变得越来越普遍,但具有挑战性的宿主样本的处理和分析问题阻止了metatranscriptomics的更广泛的临床使用。

“我们的发现表明,我们的解决方案适合还具有挑战性的样品含有微小
大量的微生物。病原体识别,它可以用来描述宿主交互。从而揭示进入气缸疾病机制。我们将进一步开发该技术作为感染我们实验室正在进行的研究的一部分。进一步的工作还将专注于理解其应用范围,“说Esko Kankuri,讲解员在赫尔辛基大学药理学。

赫尔辛基大学的博士后研究员Teija Ojala发达的新方法。接下来,Ojala会使用这项技术来提高理解COVID-19冠状病毒疾病。

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