新技术识别林奇综合征背后的重要突变
结直肠癌是第三种最常见的癌症形式。虽然90%的病例是50岁以上的人,但在年轻人上有一个尚未解释的发病率。
家庭历史在高中排名风险因素用于开发结直肠癌症通常建议有这种病史的人更频繁地进行筛查,或者在建议年龄45岁之前就开始筛查。有癌症家族史的人通常会进行基因测试,寻找与癌症风险相关的突变。然而,这些测试并不总是提供有用的信息。
在一篇新论文中美国人遗传学杂志Michigan Medicine的人类遗传学部的雅各布·伊斯坦曼博士和合作团队描述了一种用于筛选出于识别可能导致疾病的突变的不确定意义的所谓遗传变异的方法。
为了做到这一点,他们使用了一种被称为林奇综合症的遗传条件,也被称为遗传性非息肉病结肠直肠癌。就像BRCA1(一种已知会导致某些乳腺癌的基因)一样,林奇综合症背后也有一些已经被详细描述过的基因。然而,Kitzman说:“与林奇综合症相关的基因中可能存在的基因变异,我们基本上一无所知。”
因为大多数突变在人口,可能难以判断是否有任何特定的问题。并在实验室中研究一个变种一次需要大量的时间 - 通常太多可用于制定临床决策。
利用一种叫做深度突变扫描的技术,研究小组开始测量MSH2基因突变的影响,当MSH2基因发生突变时,它是林奇综合症的主要原因之一。
“关键进展是一次性的,我们按照汇总的格式做了一个突变,这使我们能够在单个批处理中测试大约18,000个突变,”kitzman说。
利用CRISPR-Cas技术,他们删除了MSH2的正常拷贝人类细胞用MSH2基因中所有可能突变的文库替换了它。这就产生了一种混合细胞,每个细胞都携带一个独特的MSH2突变。这些细胞用一种叫做6-硫鸟嘌呤的药物进行治疗,这种化疗只杀死具有MSH2功能变体的细胞。
逆行的想法是kitzman,是幸存的人细胞是那些没有msh2功能的基因,也就是那些有突变的基因最有可能导致疾病。
“我们基本上坐下来坐下来突变Kitzman说:“我们可以这样做,这样它们就可以作为新发现的基因变体的参考,或者是临床测试中发现的数千种意义不明的基因变体中的一种。”“直到现在,遗传学家还不能确定这些疾病是良性的还是致病的。”
希望是,有了其他患者特有的信息,其中一些变异可能会被重新分类,那些人被告知他们应该接受更严格的筛查。
Kitzman说,“其中一个需要一些需要一些在人类遗传领域的领域之一是为许多不同的地图创造出这些地图基因因此,当在个体中发现变异时,我们可以更具预测性。”
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