多模型方法可以帮助农民防范和控制PEDV暴发
来自北卡罗莱纳州立大学的研究人员使用三模型方法追踪猪流行性腹泻病毒(PEDV)在农场之间的传播,并分析在这些情况下不同控制策略的效果。该方法可使农民更积极主动地预防PEDV的传播,并优化其控制疾病的努力。
PEDV是一种导致断奶前仔猪高死亡率的病毒。该病毒于2013年在美国出现,到2014年已经感染了大约50%的种牛群。PEDV通过接触受污染的粪便传播。
“我们想用实际数据来比较三种不同的模型爆发北卡罗来纳州立大学人口健康和病理学助理教授古斯塔沃·马查多(Gustavo Machado)说,他是一篇描述这项工作的论文的通信作者。“然后我们就可以利用这些数据来确定每种情况下的最佳干预策略。”
该团队比较了三种模型。其中一个是PigSpread,这是一个由共同作者Jason Galvis专门开发的新型流行病学建模框架疾病在猪群中传播。另外两个模型是SimInf(一个商业疾病传播模拟器)和PoPS,后者是由北卡罗来纳州立大学地理空间分析中心开发的,用于模拟田地和森林中害虫或病原体的传播。
Machado说:“PEDV主要有两种传播方式——要么在同一农场的猪之间传播,要么在猪从一个农场转移到另一个农场时传播。”“我们选择的每个模型都有不同的优势:PigSpread着眼于每个模型的生猪数量农场和数字的差异来做预测,SimInf观察环境中的疾病,而持久性有机污染物利用数字和环境因素比如温度和降水。”
利用三家不同公司记录的PEDV爆发的数据,研究小组每周校准模型,并观察哪一个模型在每个给定的周内表现最好。
Machado说:“虽然PoPS总体上是最准确的,但每种模型都有自己的优缺点。”“我们在这里所做的类似于气象学家对天气数据建模的方式,使用具有不同强度的不同模型来提供更大的灵活性。我们每周都会对模型进行校准,我们会使用模型在最近的数据中表现最好。”
该团队结合疾病控制策略,如封闭畜群、疫苗接种和生物安全措施,分析了模型的预测能力。他们估计,通过结合建模和控制协议,母猪养殖场的疫情可以减少76%至89%,母猪养殖场的疫情可以减少33%至61%。
Galvis说:“这是一种灵活的方式,可以让农民在疫情爆发期间了解最新情况,并使他们能够做出决定。”“我们希望能够在疫情爆发之前向农民提供潜在热点地图,这样他们就可以加强监测,并先发制人地阻止疾病的传播。我们下一步将更密切地观察感染对特定干预措施的反应。”
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