研究人员开发平台以鉴定可能对药物疗法有响应的癌症突变

基因组
信用:CC0公共领域

根据新的研究结果,克利夫兰的研究人员研发了一个个性化的基因组医学平台,将有助于提前加速基因组医学研究和基因组明智的药物发现基因组生物学

该平台称为我的个人偏执狂(MPM),该平台具有交互式数据库,可以深入了解疾病相关的作用并优先考虑响应的突变疗法。

“虽然测序技术的进步赋予了丰富的癌症,弥合大规模基因组研究和临床决策之间的翻译差距的能力缺乏,“克利夫兰诊所的基因组医学研究所的助理人员,博士,博士,博士,博士,研究领先作者。”MPM是一个有助于识别新型功能突变/基因的强大工具,和癌症的生物标志物,从而加速了癌症精密药物的进展。“

使用,研究人员在33种癌症类型中综合了来自超过10,800颗肿瘤突出(基因组的蛋白质编码部分)的突变,以发展综合癌症突变数据库。然后他们系统地将突变映射到超过94,500(PPI)和超过311,000个功能性蛋白质位点(其中蛋白质彼此物理结合)并掺入患者存活和药物反应数据。

该平台分析了遗传突变,蛋白质,PPI,蛋白质功能位点和药物之间的关系,帮助用户轻松搜索临床可操作的突变。MPM数据库具有三种交互式可视化工具,可提供疾病相关突变的两维和三维视图及其相关的存活和药物反应。

另一项研究的结果发表在自然遗传学,克利夫兰诊所与其他几家机构之间的合作,有动力发展该平台。

以前的研究已经将疾病发病机制和进展与破坏人类偶联,影响细胞功能的蛋白质和PPI的复杂网络的突变/变异。突变可以通过改变蛋白质(Nodic效应)的正常功能或通过改变PPI(EDGETIC效应)来破坏网络。

值得注意的是,在自然遗传学研究人员认为,由Brigham&Wommher Southance和Harvard Medical School领导的研究发现,在PPI发生的情况下,疾病相关的突变高度富集。他们还证明了PPI改变突变与药物敏感性或抗性显着相关,以及癌症患者的存活率差。

集体,MPM能够更好地了解人类互乱网络水平的突变,这可能导致癌症基因组和治疗的新见解,最终有助于实现癌症个性化护理的目标。该团队将每年更新MPM,为研究人员和医生提供最完整的数据。

“我们的自然遗传学研究还证明了突变/变异对其他疾病的影响,“郑博士”。作为下一步,我们正在开发新的人工智能算法,将这些基因组发现转化为人类基因组信息的药物鉴定和精密药物对于其他复杂的疾病,包括心脏病和阿尔茨海默病。“


进一步探索

研究表明肯塔基州子宫内膜癌患者具有较高的达何突变率

更多信息:Yadi Zhou等人,我的个人异常:一种用于搜索网络扰动等位基因的计算基因组医学平台,将基因型与表型联系起来,基因组生物学(2021)。DOI:10.1186 / S13059-021-02269-3

程,F.,Zhao,J.,Wang,Y.等。疾病突变扰动蛋白质 - 蛋白质相互作用的综合表征。NAT Genet(2021)。doi.org/10.1038/s41588 - 020 - 00774 - ywww.nature.com/articles/s41588-020-00774-Y.

所提供的克利夫兰诊所
引文:研究人员开发平台以识别可能对药物治疗(2021,2月8日)从//www.pyrotek-europe.com/news/2021-02-platform-cancer-mutationsive -drug检索到的癌症突变的平台HTML.
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