研究人员展示了精准基因组学在癌症治疗中的前景

NUI Galway的研究人员已经确定了女性患最常见类型乳腺癌的基因组特征，这种乳腺癌可能与长期生存有关。NUI Galway研究小组利用先进的统计技术分析了乳腺癌患者的基因组，以寻找与生存率的关联。

该研究由Lydia King在NUI Galway生物医学基因组学硕士项目期间进行，已发表在国际杂志上《公共科学图书馆•综合》．

通过国家筛查项目早期发现并及时治疗被诊断为“管腔型”的患者乳房癌症治疗的预后良好，5年内存活率超过80%。然而，长期生存的挑战并没有被很好地理解，研究表明，超过一半的腔内乳腺癌复发发生在这个时间点之后。因此，确定最有可能复发的患者对于患者监测和治疗选择是非常宝贵的。

基因组是包含我们所有遗传遗传信息的细胞染色体中所有DNA的集合。癌症通常被描述为一种基因组疾病，因为它是我们细胞中某些DNA编码指令改变的结果，导致它们肆无忌惮地增殖。这些改变是肿瘤的一个标志，范围从DNA编码中的单个碱基对错误到整个染色体臂的复制或缺失。癌细胞基因组的改变程度被称为“基因组不稳定性”。

NUI Galway团队专注于在诊断时和治疗开始前观察腔内乳腺癌患者癌细胞基因组不稳定性的整体测量，是否可以为预测乳腺癌患者提供额外的信息长期生存．为了验证这一假设，他们分析了由剑桥大学领导的国际乳腺癌分子分类学联盟(METABRIC)的数据。

METABRIC是最早的多中心研究之一，旨在揭示1977年至2005年间登记的2000多名原发性乳腺癌患者的活检组织的临床和基因组特性之间的联系。拥有高质量和最新的基因组数据的丰富性临床数据使得METABRIC数据库成为研究乳腺癌的一个非常强大的资源。

Lydia和她的同事们计算了所有2000名患者基因组的不稳定性水平，然后使用多变量统计模型来确定腔腔亚型乳腺癌患者的不同长期生存结果。这使他们能够确认，在肿瘤活检中，患有最极端水平的基因组不稳定的腔腔A患者的预后明显较差。

重要的是，NUI Galway的研究人员能够将患者分层，并将基因组不稳定性评分与临床分类联系起来。这为诊断为Luminal A乳腺癌的患者具有高水平的基因组不稳定性表现出类似的降低生存率的模式，常见于患有更具侵袭性的Luminal B亚型的患者。由于被鉴定为Luminal A或B亚型的患者通常接受不同的治疗，因此该结果表明，将基因组分析纳入临床护理可以改善诊断，并允许肿瘤学家为个别患者量身定制治疗。这种使用基因组分析的方法被称为“精确(或基因组)医学”，有助于在临床实践的许多领域定义一种新的护理标准。

该论文的高级作者，NUI Galway数学、统计和应用数学学院的Aaron Golden博士说:“这是跨学科研究如何在基因组数据科学中发挥作用的一个很好的例子。这最初是我作为一个物理学家和我的同事安德鲁·弗拉斯博士的一个推测性的想法，他是自然科学学院的生物化学家，莉迪亚在她的硕士论文项目中采用了这个想法。然后我们得到了统计学家同事艾玛·霍利安博士的宝贵帮助，通过莉迪亚惊人的努力工作，我们可以证明精确基因组学的前景癌症治疗。”

在评论这一结果时，NUI Galway生物医学基因组学硕士项目总监Pilib Ó Broin博士补充道:“这对Lydia和她的主管来说是一个极好的结果，并强调了培训像Lydia这样的跨学科科学家的巨大好处，他们既拥有统计和计算技能，又拥有从基因组学数据中产生新的生物学见解所必需的领域知识，有可能改善患者护理。”

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