研究人员确定RNA编辑事件,影响基因表达和表型

结合计算挖掘大数据与实验测试在实验室里,费城儿童医院的研究人员(切)发现了RNA编辑事件影响基因的表达,进而表达的表型的表现。在分析所谓A-to-I RNA编辑、腺苷的RNA分子的化学修饰成肌苷,研究者描述单核苷酸的变化通过RNA编辑可以对下游产生巨大影响。这项研究结果发表在今天基因组生物学。

“数百万A-to-I RNA编辑网站已确定在人类转录组,但大多数RNA编辑事件的函数是未知的,“兴说,博士,计算与基因组医学中心主任剁碎,这项研究的资深作者。“了解RNA编辑如何影响基因表达和表型可以帮助我们解开遗传基础许多人类条件。”

兴博士和他的团队研究了功能的RNA编辑通过人类的视角遗传变异,或者是人们之间出现的差异在大约1000个DNA碱基对,不仅影响如何基因表达也信使核糖核酸(mrna)是如何处理的。研究人员分析了匹配的基因和转录组数据49组织437人,共有约8000人样本NIH Genotype-Tissue表达式(GTEx)项目,寻找A-to-I RNA编辑事件与个体之间的遗传变异有关。他们利用一种方法涉及分子数量性状位点(QTL)定位映射,映射分子性状基因型找到基因对基因调控的影响。分子QTL的遗传机制的研究可以提供线索管理生物过程。

使用这种方法,研究人员发现3117独特的RNA编辑事件相关的遗传变异。令人惊讶的是,14%的RNA编辑法也与基因表达的基因变异有关。比较他们的数据和可用的全基因组关联研究中数据,他们发现这些RNA编辑的一个子集法也与复杂的性状或疾病相关的人口。

理解为什么RNA编辑变化可以加上基因表达变化,研究人员主要集中在小分子核糖核酸,一类小非编码RNA调节基因的表达可以通过绑定在mRNA互补序列,导致绑定mRNA分子被降解。研究小组发现,某些小分子核糖核酸信使RNA降解或不降低其目标,取决于给定的RNA信使RNA编辑网站仍未刊行的作为一个腺苷(a)或编辑一个肌苷(我)。如果这样的RNA编辑网站是受人类基因变异下游,这可能引发一连串的事件通过改变关键信使rna分子的稳定与富足,因此这些信使rna分子表型的影响。

“有什么有用这种方法是疾病无关,“邢博士说。“未来的研究可以使用这一策略研究特定疾病看看RNA编辑事件的影响从疾病的角度。”

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