联合COVID-19检测以早期发现疫情的新战略

联合COVID-19检测以早期发现疫情的新战略
在学校/大学环境中汇集:来自共享同一教室/学生宿舍的学生的唾液或鼻子样本汇集在一个管道中;通过单分子检测(RT-qPCR或RT-LAMP)评估混合物的病毒学状态。检测呈阳性表明至少有一人感染了CoV2-SARS,从而可以及早采取行动遏制疫情。筛选过程可以定期重复。资料来源:Jean-François Rupprecht,理论物理中心(CNRS/Aix-Marseille Université/Université de Toulon), 2021年

研究人员提出了一种新的定量策略,用于汇集COVID-19检测,以监测传播并在封闭社区(如养老院或大学)早期发现疫情。法国格勒诺布尔市Université格勒诺布尔阿尔卑斯山脉的文森特·布劳和他的同事在开放获取期刊上提出了这种方法PLOS计算生物学

在供应有限的情况下,一些社区通过将个人唾液或鼻拭子样本分组,实现了大规模的COVID-19检测.如果某个池的测试结果为阴性,则池中的所有人都会收到阴性结果。如果检测结果呈阳性,后续检测将显示该池中谁呈阳性。然而,集中精力可能会稀释积极因素,当泳池中有人实际上是阳性时,结果会是阴性结果:假阴性结果。

在这项新研究中,布劳特和同事们使用量化工具来研究在封闭社区背景下的假阴性问题。虽然之前关于联合检测的研究通常侧重于尽量减少确定阳性病例所需的检测数量,但这项研究的重点是将联合检测作为跟踪COVID-19在社区中存在的一种方式。

研究组通过逆转录定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)方法,建立了估计单个样本集中用于新冠病毒检测时假阴性结果风险的数学模型。这些模型利用了单个样本中sars - cov -2(导致covid -19的病毒)浓度的大规模临床数据集。

基于这些模型,研究人员开发了一种定量的汇总测试方案,用于确定封闭社区(如养老院或大学)内COVID-19的患病率。虽然需要进一步完善,以便为实际应用做好准备,但它可以为更早地发现疫情奠定基础。

布劳特说:“我们发现,联合使用不仅是一种很有前途的方法,可以在早期阶段打破传播链,而且在估计社区病毒渗透水平方面也惊人地有效。”“我们认为,联合检测可能成为一种更广泛的工具,以对抗学校青少年中无症状的传播。”


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更多信息:Brault V, Mallein B, Rupprecht J-F(2021)群体检测作为COVID-19流行病学监测和社区监测的策略。PLoS计算生物学17 (3): e1008726。doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008726
期刊信息: PLoS计算生物学

引用:汇集COVID-19检测以早期发现疫情的新策略(2021年,3月4日)检索于2022年8月11日从//www.pyrotek-europe.com/news/2021-03-strategy-pooling-covid-outbreaks-early.html
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