研究发现，随着病毒的演变，COVID-19变异可能为预测患者预后提供线索

自COVID-19大流行开始以来，导致COVID-19的sars - cov -2病毒的突变已经蔓延到美国和全球许多其他国家。最近的研究表明，目前的COVID-19变异株的传染性比大流行的原始菌株高70%。

由克利夫兰诊所(Cleveland Clinic)和凯斯西储大学(Case Western Reserve University)的多学科科学家组成的团队利用基因组测序追踪了2020年3月11日至4月22日在俄亥俄州东北部发生突变的SARS-CoV-2。研究结果发表在《美国医学会杂志》网络开放的初始菌株和亚群病毒在这段时间内发现的菌株(称为支系)与较高的死亡率相关，而较新的变异与较低的住院率和死亡率相关。虽然这些发现与研究人员在大流行的早期发现有共同的见解，但它也可以帮助指导未来的研究，以分析新的变异如何影响病人的结果随着病毒继续进化。

这项合作研究由克利夫兰儿童诊所的儿童传染病医生弗兰克·埃斯珀医学博士领导，包括癌症基因组学、计算机和数据科学、神经学和病理学方面的专家。Brian Rubin医学博士，克利夫兰诊所Robert J. Tomsich病理和检验医学研究所主席，以及Jing Li博士，凯斯西储大学计算机和数据科学系Leonard Case Jr.教授是这项研究的共同资深作者。

为了更好地理解早期突变和分支如何改变临床结果，埃斯珀博士和研究团队分析了俄亥俄州东北部第一波COVID-19大流行期间302名患者的数据RNA序列。这些临床样本来自克利夫兰诊所COVID-19登记处，该登记处收集了近5万名接受过该疾病检测的患者的数据。

通过对每个样本与在中国武汉发现的病毒初始毒株进行测序，Esper博士和研究团队确定了488个独特的突变，与6个病毒毒株(武汉、S、L、V、G、GH支系)相关。

结果显示，在克利夫兰大流行的最初六周内，早期病毒株已被确定，并导致了更高的疾病死亡事件。然而，在几周内，这些早期的病毒毒株被更具传染性的毒株所超越，这些毒株与较低的住院率相关，并在住院时提高患者生存率。

鲁宾博士说:“这项研究详细描述了不同的COVID-19分支在被带到克利夫兰后是如何进化和竞争的。”“病毒分支与结果之间的联系非常重要，并突出了病毒基因组测序对加深对新疾病的理解的重要性。”

2019冠状病毒病多样性最大菌株发生在限制病毒传播的社区策略建立之前的最初几周。州和联邦政府的反应可能已经阻止了来自社区以外的新变异的继续引入，从而降低了总体死亡率。

埃斯珀博士说:“这些发现使我们更深入地了解，随着大流行的发展，COVID-19感染如何显著超过COVID-19住院率和死亡率。”“这项研究也有助于验证病毒分支如何在预测患者预后方面发挥重要作用。”

“这项研究进一步证实了在整个大流行期间研究病毒基因组变异的重要性，”李补充说。“这也清楚地展示了团队科学的价值——一个高度整合和互动的团队，拥有不同的优势和专业知识，但拥有共同的愿景——在应对挑战方面。”

随着时间的推移，病毒不断变异，专家们不能确定这些新变异将导致的疾病严重程度或死亡率。广泛接种疫苗是减缓病毒传播的一项重要公共卫生战略。广泛接种疫苗将有助于减少潜在致命变异的出现。在实现群体免疫之前(专家估计约有70-80%的人口接种了疫苗)，每个人都应该继续戴口罩，保持社交距离，经常洗手，避免聚集。目前，只有34%的美国人完全接种了疫苗，52%的人至少接种了一剂，美国疾病控制和预防中心的数据显示。

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