快速,便携式测试可以诊断Covid-19和轨道变体
使用新的病毒筛查测试的临床医生不仅可以在几分钟内诊断Covid-19,还可以同时测试其他病毒样流感 - 这可能被误认为是冠状病毒。同时,它们可以序列病毒,提供有关Covid-19突变和变体的传播的宝贵信息。Dubbed Nirvana的新测试在今天在线在线描述了Chinese的科学家多机构团队Med。
“这是一种病毒检测和监测方法,不需要像其他方法一样的昂贵的基础设施,”Juan Carlos Izpisua Belmonte,Co-Mevishion作者和Salk基因表达实验室教授。“我们可以用一个便携式完成测试其他人使用两种或三个不同的测试,用不同的机器来做。“
世界各地,超过1亿人被SARS-COV-2感染,导致Covid-19的病毒。迄今为止,令人惊越的500,000名美国人死于Covid-19。测试人口是阻止病毒传播的关键。此外,跟踪新SARS-COV-2变体的扩散 - 其中一些可以对治疗或疫苗进行不同的反应 - 至关重要。
今天,确定鼻拭子是否对Covid-19是阳性的标准方法是运行聚合酶链反应(PCR)检测SARS-COV-2病毒的遗传物质。然而,如果样本是阴性的,患者和临床医生没有得到任何关于可能导致冠状病毒样症状的信息 - 除非他们使用不同的拭子样本,其他病毒将单独的PCR测试运行。如果样品对于SARS-COV-2呈阳性,则除非运行另一组测试,否则它们不了解患者感染哪些Covid-19变体;那些需要一个大而昂贵的下一代基因测序机。
去年夏天,沙特阿拉伯国王科技大学生物科学助理教授的助理思考方式,他可以借给遗传工程和纳米孔测序的专长,以打击Covid-19大流行。李先生六年作为Izpisua Belmonte Lab的Salk Proddoctoral研究员,想知道一种称为等温重组酶聚合酶扩增(RPA)的基因检测方法是否与实时纳米孔测序相结合可能更有用 - 更快,更便宜,更便宜,更便宜更多便携式比当前的Covid-19测试方法。他与Izpisua Belmonte一起寻找。
与PCR不同,循环通过较低和更高的温度分离DNA链并复制它们,RPA使用蛋白质 - 而不是温度变化 - 仅在20分钟内完成相同的东西。该技术让研究人员同时复制更长的DNA和对多种基因的探针。
“我们很快意识到我们可以使用这种技术不仅可以检测SARS-COV-2,而是同时检测其他病毒,”李说。
在新的论文中,Li和Izpisua Belmonte描述了一种小型便携式设备,可以使用RPA测定同时筛选96个样品。他们称之为Nirvana,“纳米孔测序对等温快速病毒扩增进行近实时分析”。
科学家设计了Nirvana,同时测试Covid-19,流感A,人腺病毒和非SARS-COV-2人冠状病毒的样品。在研究人员报告的情况下,该设备开始报告正面和负面结果。在三个小时内,该装置最终确定所有96个样本的结果 - 包括SARS-COV-2的五个区域的序列,特别容易累积导致英国中所识别的B.1.1.7变体等新变种的突变。
李和Izpisua belmonte在10个样品上测试了Nirvana,该样品对于SARS-COV-2,60个未知的SARS-COV-2状态的样本以及含SARS-COV-2的市政废水的样本病毒和别的。在所有情况下,测定能够正确鉴定存在哪些病毒。测序数据还允许它们缩小阳性样本中的SARS-COV-2的起源;例如,差异化来自中国和欧洲的菌株。
“这个试验的设计非常灵活,因此它不仅限于我们所示的例子,”李说。“我们可以轻松调整它来解决另一个病原体,甚至是新的和紧急。”
与之小尺寸和Nirvana工作流的可移植性,它可以快速使用病毒检测研究人员说,在学校,机场或港口。它还可用于监测污水或溪流以存在新病毒。
“大流行已经提供了两个重要的教训:首先,广泛快速地测试,而第二,知道您的变体。我们的Nirvana方法提供了对这两个挑战的有希望的解决方案,而不仅适用于目前的大流行,而且为可能的未来的挑战提供了一个有希望的解决方案贝尔蒙特,拿着罗杰·威廉宁椅在Salk。需要进行市场分析来确定商业化的初始成本 - 以及确保其检测到新变种或新病毒的测试所需的测试 - 是值得的,所以是值得的。
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