SARS-CoV-2变种如何牺牲紧密结合来逃避抗体

最近出现在南非的高度传染性SARS-COV-2变体，称为B.1.351，有科学家们想知道可以改善现有的Covid-19疫苗和疗法，以确保强烈的保护。现在，研究人员报告ACS'医药化学杂志使用计算机建模揭示了使变体B.1.351与原始SARS-COV-2不同的三种突变之一减少了对人体细胞的病毒 - 但可能允许其逃避一些抗体。

自2019年底首次检测到原始SARS-COV-2以来，已经出现了几个新的变体，包括来自U.K.，南非和巴西的几种新变种。由于新的变体似乎更加传播，因此迅速传播，许多人担心他们可能会破坏当前疫苗，抗体疗法或自然免疫。变体B.1.351熊两次突变(N501Y和E484K)可以增强冠状病毒刺突蛋白受体结合域(RBD)与人ACE2受体之间的结合。然而，第三个突变(K417N;417位赖氨酸到天冬酰胺的突变)是令人困惑的，因为它根除了RBD和ACE2之间的良好相互作用。因此，IBM研究中心的栾斌泉(Binquan luynh)和黄田(Tien Huynh)希望研究K417N突变的潜在益处，该突变可能导致冠状病毒沿着这条路径进化。

研究人员使用分子动力学模拟分析Variant B.1.351中K417N突变的后果。首先，它们在原始SARS-COV-2 RBD和ACE2之间以及RBD和CB6之间建模的结合，其是从回收的Covid-19患者分离的SARS-COV-2中和抗体。他们发现原有的氨基酸，赖氨酸，在RBD中的位置417，与CB6相互作用，而不是与ACE2相互作用，与抗体在动物模型中的治疗效果一致。然后，团队与K417N变体建模的结合，这将赖氨酸变化为天冬酰胺。虽然这种突变降低了RBD和ACE2之间的结合强度，但它将RBD与CB6的结合和几种其他人抗体降低得多。因此，变体B.1.351似乎在该位点处牺牲了与ACE2的紧密结合，以避免免疫系统。研究人员说，这些信息可以证明科学家们为加强当前疫苗和疗法的保护而有用。

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