转录因子如何共同作用于癌症的形成

一项由科罗拉多大学癌症中心研究员Srinivas Ramachandran博士合著的新研究显示了被称为增强子的DNA片段是如何在细胞中发挥作用的。

论文发表在上个月分子细胞突出了Ramachandran的作品，以及Satyanarayan Rao，两部分生物化学和Cu医学院的分子遗传学系，以及来自Fred Hutchinson Cancer Research Center的Kami Ahmad。

增强剂是驱动细胞类型特异性基因表达，发育过渡和对外部刺激的细胞反应的DNA序列。它们通常具有多个绑定站点转录因素，这是通过与附近的DNA结合，有助于改变特定基因或“OFF”的蛋白质。Ramachandran希望了解这些多个结合位点的作用在驾驶增强功能中的作用，以及转录因子随机或以协调的方式与多种增强子位点（以生物学中的协调为“合作”）。

“把增强剂中的两个结合位点想象成咖啡店桌子上的两把椅子。这些椅子可以被陌生人占据。他们到达和离开桌子的时间是随机的，任何时候他们重叠都是纯粹的偶然。如果两个朋友出现在咖啡店，他们会比随机的陌生人花更多的时间在一起，”他说。

“在生物学上，同时占据增强剂的转录因子的含义非常大。我们的起始因素比咖啡店的朋友更像是陌生人。如果有任何合作，我们想开发方法。如果有任何合作，如果我们发现任何，那么询问细胞如何使因素在一起。“

研究人员观察了果蝇细胞的结合过程，开发了两种方法来观察多个转录细胞是在增强子的两个相邻结合位点结合在一起还是单独结合。

“那么我们就可以问，他们希望在一起待多久?”拉马钱德兰说。"如果我们知道一个人在50%的时间内受到约束另一个人在50%的时间内受到约束，那么我对不合作行为的期望是，通过乘以这些概率，他们在25%的时间内偶然在一起。但如果其中两个人在40%的时间里在一起，那就意味着存在某种合作。在某种程度上，增强子有条件使转录因子结合在一起时间。"

研究人员发现，高达60%的增强剂，他们观察到至少有一个协调结合事件，这意味着转录因子一起开启和关闭，共同作用，关闭和打开基因。他说，如果科学家能更好地理解这一过程发生的原因，他们可能就能更好地理解增强子是如何被癌症等疾病吸收的。

“它回到了增强者的发展方式以及如何增强者功能，”Ramachandran说。“如果您认为癌症，它的细胞会从正常细胞改变其身份。它们正在利用存在的系统，但通常在该细胞类型中沉默。了解Enhancers如何工作，让我们了解他们如何利用它们细胞在疾病期间改变他们的身份。”

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