一年的SARS-CoV-2进化
许多SARS-CoV-2变异出现在免疫力低下的宿主,研究确定。人们认为,变异的问题B.1.1.7,变体在Kent-were首次发现的结果长期感染免疫系统较弱的人。
持续性感染在免疫功能不全的人可能导致病毒变异更频繁,因为人的免疫系统不能尽快清除病毒的免疫系统健康的人。
作者教授温迪·巴克利博士Thomas孔雀,朱利安Hiscox教授和丽贝卡Penrice-Randal解释基因变化监测的重要性SARS-CoV-2未来控制病毒的:“随着越来越多的变体的出现,我们得到了一个更好的图片共享的异同,可以更好地预测其他新变种会是什么样子。一起把所有这些信息也将有助于我们设计升压疫苗预防尽可能多的变异或设计有针对性的诊断”他们说。
他们审查讨论发生了变异,他们的一部分病毒影响和由此产生的变异如何影响疫苗接种工作。根据作者,突变SARS-CoV-2预计,随着病毒适应人类。“测序人类季节性的冠状病毒尚未完成规模像SARS-CoV-2,特别是当他们最初会传播给人类。SARS-CoV-2是在人类旅程的开始而其他人类冠状病毒已经存在,在某些情况下,几十年来”他们说。
变异与相同或类似的独立突变出现在不同的国家:“SARS-CoV-2可能仍然发现在人类最佳的感染和传播。爆发的规模和大规模测序的努力将确认并发突变;基本上,该病毒正在相同类型的选择压力世界上无论你在哪里,和爆发都是相同的原始播种的病毒,”作者解释道。
特别感兴趣的突变包括飙升的蛋白质。这种蛋白质使病毒进入宿主细胞是免疫系统的主要目标,包括所有当前SARS-CoV-2所产生的免疫疫苗。
编码基因的突变可以改变蛋白质的形状,让它不再被免疫系统识别。因为这种蛋白质很重要SARS-CoV-2条目,有利突变更容易成功和创造新的,主要病毒的变异。
变化,给病毒优势可以很快成为主导。例如,一个突变,名叫D614G,被发现在80%的SARS-CoV-2病毒测序就四个月后被检测到。现在,没有D614G突变病毒只在非洲部分地区常见。
找到另一个突变,N501Y B.1.1.7 SARS-CoV-2变体。这种突变的结果被认为是感染的免疫功能不全的个人和可能导致更多的传染性的病毒。感染这种变体有更高的死亡率。在英国,三个月内B.1.1.7成为占主导地位的变体,现在负责超过90%的感染。
明显突起蛋白突变在审查讨论包括:
D614G:
2020年2月,突变检测的突起蛋白SARS-CoV-2和D614G命名。这种突变被发现使得SARS-CoV-2更多的传染性,但并不会使病毒更有害。这种传染性的增加导致了巨大的体能优势和在四个月内,80%的全世界SARS-CoV-2病毒测序发现突变。现在,只有非洲部分地区传播病毒没有D614G突变。
尽管最初的担忧,D614G没有影响疫苗效率和在某些情况下,病毒与D614G突变更容易通过抗体SARS-CoV-2。
Y435F:
2020年中期,貂感染的报告由人类变得频繁。貂,病毒的突起蛋白通常发达两个突变称为Y435F和N501T。这些突变允许强约束力的病毒的人类受体细胞。这些突变的病毒被发现在一群人类感染在丹麦,认为起源于貂皮。有关,这种变体能够感染人以前感染SARS-CoV-2和被认为对病毒有免疫力。因此,1700万貂被扑杀。
突变Y435F也被报道了一个免疫力低下的人,可能是由于慢性感染病毒让它适应。
N501Y:
2020年12月,一个高度传染性病毒的变种是孤立的肯特郡,英国。这变种,名叫B.1.1.7,包含突变的蛋白质称为N501Y。这不仅突变使病毒更具有传染性,但它也发现有更高的死亡率。在英国,B.1.1.7现在占主导地位的变体,并负责超过90%的感染。
突变N501Y被发现没有影响免疫疫苗和先前的感染。
E484K:
的蛋白质突变E484K已经出现在最近几个月,一次在南非和至少两次在巴西。变异的突变E484K能够逃避之前接种疫苗和感染者的免疫系统。
人们认为这种突变是由高水平的人口免疫力,开车峰值突变蛋白质逃避免疫系统。在巴西,曾有一些报道说卫生保健工作者和其他的人抗体SARS-CoV-2重新感染了变体E484K突变,提高对这种变体的疫苗保护的担忧。
审查也检查突变改变病毒的其他部分,比如ORF8,从犯蛋白质被认为可以抑制宿主的免疫系统。病毒编码的基因的删除ORF8被发现导致更严重的临床疾病。
评论的作者呼吁全球努力增加监控SARS-CoV-2突变。目前英国和丹麦执行不成比例的高SARS-CoV-2基因组的测序。定期监测病毒的允许早期识别新兴变异和允许研究人员识别相关的突变。
“尽管基因组监测在欧洲和美国是相当强劲,显然有大面积的世界,我们只是不知道变异是循环的。这些是开始出现在欧洲进口或社区暴发。更好的监测在更广泛的国家将允许我们更好的风险评估大流行可能的下一个阶段是什么样子,”作者说。“如果我们想监控正在进行的出现,传播,和进口的潜在疫苗逃避突变,我们必须继续努力失败或风险进一步流行波和疫苗。此外,了解病毒的基因流行病学尽早将使我们能够快速开发更新疫苗推进器。”
阿兰•科尔教授,副主编普通病毒学杂志说:“SARS-CoV-2变体的出现是一个伟大的挑战正在进行的大流行。本文回顾总结了我们当前的知识和理解病毒的进化,以及后果的例子而言,接种疫苗。是感兴趣的任何人都希望更多地了解它的历史病毒什么将来。”
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