Queens的冠状病毒传播使第一波纽约城的大流行
![Spatio-temporal analysis of viral genomes that help determine when and where SARS-CoV-2 dispersal occurred during spring of 2020 in the greater New York City area. It shows that most peripheral samples are directly connected to the NYC area rather than clustered together, indicating that samples collected outside NYC likely correspond to distinct dispersal events originating from the city area. Credit: Dellicour S et al., 2021, PLOS Pathogens 新的研究地图Covid-19纽约第一波流行浪潮的分散动态](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2021/new-research-maps-covi.jpg)
一项新的研究发现,纽约市,皇后区和布鲁克林的人口最多的自治市镇,皇家和布鲁克林可能担任Covid-19的主要中心,这是一个新的研究发现。
由纽约Grossman医学院的研究人员领导,新调查分析了800多名冠状病毒遗传样品追踪病毒的道路,因为它在大流行的致命第一波遍布纽约市旅行。它确定了女王,在较小程度上,布鲁克林作为大多数情况的可能起源点,其中更多的案例在其边界内循环并从城市的这些部分蔓延到曼哈顿和外部自治市镇中。
“我们的调查结果似乎确认了皇后区作为纽约大都市地区其他地区的冠状病毒传播早期震中的作用,”研究共同高级作者Ralf Duer,MD,Ph.D。“现在我们了解病毒爆发如何在社区之间传播,我们可以更好地计划未来的凝视并在最脆弱地区进行测试优先考虑测试。”
DUER是NYU Langone Health的病理学部的研究助理教授,如果疾病再次传播冠心病袭击纽约的疾病,则可能遵循该地区的相同基本路径。
虽然需要更多的研究来确定传播背后的潜在原因,但研究人员怀疑通勤可能发挥了关键作用。Duerr指出,35%的女王和布鲁克林工作人员每天旅行到曼哈顿,乘坐汽车,地铁和公共汽车。此外,这座城市的主要机场,Laguardia和J.F.K.,位于皇后区。Duer表示,那个被大流行,不成比例地使用的黑人和西班牙裔美国人遭受特别艰难的美国人,并居住在这两个自治市镇中可能是另一个可能的因素。
过去的研究表明,Coronavirus于2020年2月底刚刚在纽约扎根,超过一百个独立的爆发源爆发到感染链中,而不是从单一的患者零。“然而,在各个自治市镇内部和之间的病毒涂抹的动态仍然不清楚。
![新的研究地图Covid-19纽约第一波流行浪潮的分散动态](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800/2021/new-research-maps-covi-1.jpg)
新研究,发布5月20日期刊PLOS病原体根据DUER,旨在精确地跟踪五个纽约市政府和长岛的冠状病毒和长岛。
在基因测序中,研究人员比较遗传密码的小剪辑,以鉴定仅在病毒的特定菌株中发现的突变。这些“旗帜”的研究人员说,然后可以用来映射菌株随时间蔓延的时间和地点,类似于用于追踪人们的祖先的测试。专家以前使用这种技术遵循流感爆发,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和埃博拉,以及其他流行病。
对于新调查,研究人员分析了从数百种鼻拭子收集的病毒遗传信息。从3月到2020年至5月到2020年5月,从纽约市和长岛进行了对Covid-19阳性测试的男性和女性。使用不同的突变标志,所收集的样本和患者ZIP代码,研究调查人员创造了计算机模拟通过该地区追踪病毒的路径。该研究在Nyu Langone的基因组技术中心进行。
他们发现,10个模拟中的八个指向女王作为病毒的主要中心在第一波感染中传播。同时,其他两种模拟分别确定了Brooklyn和Bronx作为大流行震中,这位研究作者说,这两个自治市镇在整个城市的病毒传播中发挥着重要意义。
过去的研究依赖于住院数据来推断出爆发的旅行方式。研究作者表示,新发现提供了更直接的感染映射。
“这些基因测序和计算机建模技术可以通过寻求追踪当量在大规模测试和联系跟踪有限的情况下如何传播病毒的社区来使用,”研究共同高级作者Adriana Heguy,Ph.D。
纽约Langone病理学系教授的知名度鼓励美国和国外的其他公共卫生官员使用这些方法来绘制大流行如何在其城市传播。
她说,研究团队下次计划应用调查研究中的方法新冠病毒在纽约大流行病的第二波中传播。
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