新的DNA研究可能有助于对抗目前治疗方法无法抵抗的癌症

新的DNA研究可能有助于对抗目前治疗方法无法抵抗的癌症
摘要SynLeGG利用多sep基因表达聚类划分CRISPR重要性评分(上)和全外显子组测序的突变(下),以预测候选遗传依赖关系,包括合成致死率。信贷:核酸的研究(2021)。DOI: 10.1093 / nar / gkab338

贝尔法斯特女王大学(Queen's University Belfast)领导的一项开创性研究发现,在对700多种不同癌细胞类型的分析中,数千种“阿基里斯之踵”或“癌症弱点”被发现。

在未来,这可能会导致新的方法来停止通过使用现有的药物,以及提出药物开发的新目标,细胞在他们的轨道上。

这些药物甚至可以用于对抗对目前标准治疗方法有耐药性的癌症。

该研究已发表在该杂志上核酸的研究

为了进行这项研究,研究人员创建了一个名为“MultiSEp”的计算机程序,可以分析大型复杂的数据集。

伊恩·奥弗顿博士是女王大学帕特里克·G·约翰斯顿癌症研究中心(PGJCCR)的高级讲师,他说:“了解癌症的分子指纹可以精确地定位药物,使其在最有效的病人身上发挥作用。”我们的工作向更有效和个性化的癌症治疗迈出了一步,最终挽救了生命。

我们在“合成致命与遗传学和基因组学的web服务器上提供了我们的结果,打开了一个窗口,与跨为了加速进展在全球范围内。”

癌症通常有许多突变,这些突变会导致基因弱点或“阿喀琉斯之踵”。例如,癌症经常通过突变来阻止一些称为肿瘤抑制基因的保护基因,从而变得更危险——使肿瘤依赖于一个备份基因。

因此,用“化学锤子”击打后备基因,可以杀死

这个新项目已经在超过700种不同类型的癌细胞中识别出了数千个备份基因,为设计更有效的治疗方法来对抗癌症提供了智慧。

来自皇后大学PGJCCR的高级讲师Simon McDade博士说:“这项研究为世界各地的研究人员从功能基因组筛选中提取宝贵的数据提供了重要的资源,从长期来看,这有可能为癌症患者带来重大益处,同时也为世界各地的研究人员方便、更有效地分析基因数据。”

皇后大学PGJCCR荣誉讲师、Almac Discovery生物信息学负责人Mark Wappett领导了这项研究,他说:“我们的研究结果为更广泛的科学界提供了使用前沿技术生成的关键数据集的途径,并提供了一个分析这些数据的工具包。

“最终,我们希望,通过增加这些数据的使用,我们可以加快更有针对性和更有效的癌症治疗。”


进一步探索

新的计算方法检测癌症中中断的途径

更多信息:Mark Wappett等人,SynLeGG:分析和可视化多组学数据,以发现癌症“阿基琉斯之踵”和基因功能关系,核酸的研究(2021)。DOI: 10.1093 / nar / gkab338

MultiSEp的结果可在www.overton-lab.uk synlegg

期刊信息: 核酸的研究

引用:新的DNA研究可能有助于对抗目前治疗方法耐药的癌症(2021年5月24日
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