与Covid-19风险相关的基因确定

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信用:CC0公共领域

根据ATS 2021国际会议的研究,在ABO基因中具有显着增加开发Covid-19的机会,还可以显着增加开发Covid-19的机会,而其他基因也可能会增加Covid-19风险。

关于Covid-19仍然是一个医疗谜,包括某些基因是否将个体放在收缩SARS-COV-2病毒的风险,这导致Covid-19。Ana Hernandez Cordero,Ph.D.,博士后的哥伦比亚大学心灵创新中心,同事使用综合基因组学与蛋白质组学结合鉴定这些基因。

基因组研究确定这可能在诸如疾病的发展之类的生物过程中发挥作用,而蛋白质组学对蛋白质具有相同的作用。研究人员可以通过整合工具来调查两者来获得更全面的疾病过程。

埃尔南德斯博士说:“DNA是一种庞大而复杂的分子,因此,仅凭基因关联无法确定导致COVID-19的确切基因。”“然而,通过将COVID-19基因信息与基因表达和蛋白质组数据集相结合,我们可以找出哪些基因推动了与COVID-19的关系。”

研究人员合作考察肺基因表达以鉴定血液中的遗传变异,其控制肺部的基因表达,该血液中负责Covid-19。研究人员确定了与Covid-19易感性的基因表达和蛋白质水平的特定基因标记物。对于分析,它们使用生物信息学结合:(1)从被SARS-COV-2感染的患者以及未感染的个体(对照)获得的基因组数据集;(2)来自临床群体的肺和血液组织基因表达数据集(非Covid-19);(3)从献血者获得的蛋白质组数据集(非Covid-19)。

通过这样做,他们发现负责免疫系统对Covid-19反应的几个基因也参与了Covid-19易感性。他们发现的是通过先前研究的结果支持的。

寻找血液蛋白中的候选基因,它们能够进一步逐步,在将基因的影响与Covid-19的易感性连接到易感性上。血液蛋白质组学还可以帮助鉴定血液中的标志物,可以很容易地测量以指示疾病状态,并且可能是监测疾病。

“通过利用基因组信息的力量,我们鉴定了与Covid-19有关的基因,”Hernandez博士说。“特别是,我们发现ABO基因是Covid-19的重要风险因素。特别值得注意的是血液组和Covid-19风险之间的关系。我们表明这种关系不仅仅是一个关联而是因果关系。“

除了ABO基因外,Hernandez博士还发现,携带SLC6A20,ERMP1,FCE11G和CA11携带某些遗传变异的人具有明显更高的收缩COVID-19的风险。“这些人应该在大流行期间极其谨慎。这些基因也可能证明是疾病以及潜在的药物目标的良好标志物。”

研究人员分析中发现的几种基因已经与呼吸系统疾病相关联。例如,ERMP1已与哮喘有关。CA11还可以提高糖尿病人的Covid-19风险。

使用整合基因组学(Ig)合并Covid-19和基因和蛋白质表达的遗传缔组合。IG旨在识别机制(例如:将遗传密码与复杂疾病的影响连接的水平。这些方法虽然复杂,也是快速的,其结果可以帮助研究人员优先考虑体外(在实验室中)和体内(在生物体)测试中的候选基因。

Hernandez博士补充说:“我们的研究已经进展了我们首次进行了此分析的时间。我们现在已经确定了更有趣的Covid-19候选人,如IL10RB,IFNAR2和OAS1。这些已与严重的Covid-19相关联。它们在免疫反应对病毒感染和安装证据的作用表明,这些候选人及其在Covid-19中的作用应进一步调查。“


进一步探索

辨别分子相互作用可能是严重Covid-19的精密药物的靶标

更多信息:A. I. Hernandez Cordero等。综合基因组分析突出了Covid-19的潜在遗传危险因素。会议.thoracic.org/progra ... search.php?sid = p9325
所提供的美国胸部社会
引文:与Covid-19风险相关的基因(2021,5月14日)从https://medicallexpress.com/news/2021-05-genes-covid-.html检索到2021年5月14日
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