3D基因组结构影响癌症

根据一对西北医学研究，科学家们研究了患者基因组的三维（3D）结构如何有助于膀胱癌和小儿脑肿瘤。科学推进和基因组生物学．

在每个细胞内，需要适当地折叠和组织两米长的DNA，使其在核内部配合，这通常是直径仅为几微米。在很多场合，DNA形成“环”，使得在整个基因组的展开时通常相隔的基因组元素。其中一些环可以导致有害的癌基因激活，这些研究有助于确定新的治疗机会，据冯跃，博士，博士，苏珊伯纳姆的分子医学教授，高级作者基因组生物学学习与共同高级作者科学推进学习。

“癌症基因组的独特3D结构可以帮助我们调查旨在为生物标志物和治疗的靶向的目标，”Yue表示，他也是生物化学和分子遗传学的副教授，对癌症基因组学中心的病理学和主任西北大学罗伯特H. Lurie综合癌症中心。

染色质回路影响膀胱癌

根据发表的一项研究，染色质的3D结构会影响膀胱癌的进展基因组生物学．肌肉浸润性膀胱癌主要有两种亚型:基底型和管腔型。腔内癌侵袭性较低，而基础癌侵袭附近的组织并与较差的生存率相关。两个亚型膀胱癌他还说，这些基因表达谱和表观遗传特征可以被用作生物标志物。他同时也是增强智能医学研究所高级分子分析中心的主任。

“通过测量这种签名，您可以估计他们的疾病结果是否可能更好或更糟，”岳说。

在研究中，岳及其合作者在每种亚型的多个患者样本中分析了表观胶质特征和染色质循环，定义了独特的监管签名。这些环通常将远处调节剂带到其靶基因中，并且每个亚型有特定的环，根据yue的说法调节该亚型的关键癌症。

“他们需要在3D空间中联系并互相交谈，”岳说。

从这些调查结果来看，科学家们确定了超过7,000个表观遗传调节元素，为每种亚型建立表观遗传型材。此外，科学家们还鉴定了名为NPAS2的新型调节基因，其与腔亚型高度相关。据Yue表示，患有高NPAS2表达的患者可以使用更好的存活率，并且该调节剂可以用作生物标志物以确定治疗过程，甚至可能会尝试改变疾病进展。

“我们可能能够操纵NPAS2和其他关键调节器，以便我们可以诱导癌症亚型切换，这将对癌症患者的预后和治疗产生深远的影响，”岳表示。“这就是我们现在正在努力的。”

异常环燃料脑癌

根据本研究的作者发表的作者，染色体环斑循环与弥漫性的内在猪胶质瘤（DIPG）有关，致死于致命的小儿脑癌科学推进．Juan Wang是生命科学（DGP）的Driskill毕业计划中的第三年学生，是该研究的主要作者。

大多数情况下，染色质在细胞的细胞核中凝结。中细胞分裂，染色质未包装以促进DNA复制和基因表达。但是，在“解包”过程中，其中一些三维性能是维持的。

在正常细胞，这些相互作用的基线量或染色质环。但是当检查DIPG细胞时，调查人员发现了更多的循环事件。值得注意的是，它们测量了皱巴巴的DNA比例的变化与读取的开放性。基本上，他们发现DNA不必要地从“储存”中取出，有助于有助于引起的新遗传相互作用癌症．

使用抑制一些表观遗传信号传导的小分子药物，研究人员发现DIPG细胞由于抑制剂经历了较少的环，并且减少了有害基因的表现下降，表明该途径可能成熟治疗介入。

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