大多数在菜肴中生长的癌细胞与人的癌细胞几乎没有共同点
为了找到或完善癌症的实验室研究模型，以更好地比较活着的人，约翰·霍普金斯医学科学家报告说，他们开发了一种新的基于计算机的技术，表明在培养菜肴中生长的人类癌细胞在遗传上是最不相似的向他们的人类来源。
他们说，这一发现应有助于将更多的资源集中在癌症诸如遗传工程小鼠和人类组织的3D球等研究模型被称为“肿瘤”，以更好地评估人类癌症生物学和治疗，以及导致癌症生长和进步的遗传错误。
“这对科学家来说可能并不令人惊讶癌细胞系在遗传上不如其他型号，但我们感到惊讶的是，相比之下，基因工程的小鼠和肿瘤的表现非常出色。新研究的医学和首席研究员。
新技术称为CancerCellnet，使用计算机模型比较研究的RNA序列模型带有来自一个的数据癌症基因组图集比较两组匹配的程度。
研究人员发现，平均而言，基因工程的小鼠和肿瘤序列的RNA序列与基因组地图集基线数据最紧密地对齐，而每5分中有4个序列肿瘤类型他们测试了包括乳房，肺和卵巢癌。
调查人员说，他们的工作增加了癌症的证据细胞系由于人类细胞的自然环境与实验室生长环境之间存在复杂的差异，在实验室中生长的与人类来源的平价较小。卡汉说：“一旦您将肿瘤从自然环境中取出，细胞系就会开始改变。”
全世界的科学家依靠一系列研究模型来提高他们对癌症和其他疾病生物学的理解，并为疾病开发治疗方法。最广泛使用的癌症研究模型是通过从人肿瘤中提取细胞并在实验室烧瓶中用各种营养成分而产生的细胞系。
研究人员还使用经过基因工程来发展癌症的小鼠。在其他情况下，它们将人类肿瘤植入小鼠，这是一种称为Xenografting或使用肿瘤的过程。
为了评估这些研究模型中的任何一个与人可能发生的事情的一致性，科学家经常从肿瘤或异种移植物中移植实验室培养的细胞或细胞到小鼠中，看看细胞是否应像应有的行为一样，也就是说，即成长和扩散和传播和传播和传播和传播和传播保留癌症的遗传标志。但是，约翰·霍普金斯（Johns Hopkins）的研究人员说，这一过程是昂贵，耗时且科学挑战的。
新工作的目的是开发一种计算方法，以一种不那么麻烦和准确的方式评估研究模型。关于这项工作的报告已于4月29日在基因组医学，研究人员已向他们命名为Cancercellnet的临时专利申请了专利。
新技术基于遗传信息关于细胞RNA，类似于DNA的分子串，以及用于将DNA转化为蛋白质生产的中间指令。
Cahan说：“ RNA对于细胞类型和细胞身份来说是一个很好的替代品，这是确定实验室开发的细胞是否类似于其人类对应物的关键。”“ RNA表达数据非常标准化，可用于研究人员，并且较少受到研究结果混淆的技术变化。”
首先，Cahan和他的团队不得不选择一组标准数据，这些数据是比较研究模型的基准。来自癌症基因组图集的数据是所谓的“训练”数据，其中包括数百个患者肿瘤样本的RNA表达信息及其相应的阶段，等级和其他肿瘤信息。
他们还通过将其应用于已经知道的肿瘤类型的数据，例如来自国际人类基因组测序联盟，通过将其应用于肿瘤类型的数据来测试。
研究小组的成员通过癌症基因组图集数据梳理，以确定22种肿瘤研究。他们使用基因组图集数据作为基线，用于比较全球实验室中种植的657个癌细胞系的RNA表达数据，其中一些是数十年前建立的，有415种异种移植物，26个基因工程的小鼠模型和131个瘤状样型。
在研究中的一个例子中，前列腺癌细胞他指出，从一条名为PC3开始看起来更像膀胱癌的系列。他说，这也可能是细胞系最初被错误地标记，或者实际上可能是来自膀胱癌。但最重要的是，从遗传角度来看，前列腺癌细胞系并不是代表性的替代前列腺癌中发生的事情。
研究人员发现，使用0-1评分方法，平均而言，与肿瘤和异种移植物相比，平均而言，与Atlas数据的评分比对更低。
卡汉说，他和他的团队将添加其他RNA测序数据，以提高cancercellnet的可靠性。
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