COVID-19实验室泄漏假设:看似合理，但并不意味着有目的的基因改造
在昨天的七国集团峰会结束时，各国领导人呼吁达成一项新鲜透明的调查确定COVID-19大流行是如何开始的。
我对引起COVID-19的SARS-CoV-2病毒可能的“实验室泄漏”起源重新产生兴趣表示欢迎。这不是感染性病原体第一次意外从研究实验室释放出来。
我的个人经验告诉我。回到1994年，我在斯坦福大学担任研究员的第一天，我在前台拿起一个潮湿的快递包裹，把它带回了实验室。我的教授立刻戴上了乳胶手套。包裹里有一个小瓶子，里面有一个感染艾滋病毒的淋巴结。
用来包装样品的干冰蒸发了，浸湿了纸板。我就在那里，一个以前没有接触过艾滋病毒的人，因为拿着一个装有活病毒的盒子，手都湿了。
我没被感染但这次经历让我敏锐地意识到事故是多么容易发生。一个2018审查在1982年至2016年期间，仅在亚太地区就发现了27例实验室获得性感染病例。病原体列表包括了从引起登革热的病毒到SARS冠状病毒的各种病毒。
美国生物安全协会(ABSA)维持检索数据库的报告实验室获得性感染．它记录了“从塑料袋在负压输送室中”以及“清理泄漏物时暴露在液滴中”，以及其他许多例子。
仅从科学的角度来看，调查实验室泄漏的假设是很重要的，因为如果是真的，我们必须加强安全程序，以防止未来的泄漏。
两种实验室泄漏假说
近18个月前，当武汉首次报告这种病毒时，人们提出了这种病毒出现在武汉病毒学研究所的可能性，该研究所正在进行SARS冠状病毒的研究。
这个实验室泄密假说有两种说法。首先，作为研究的一部分，病毒可能是从感染了SARS冠状病毒的动物(或动物组织)身上跳下来的。被感染者随后感染了社区中的其他人。
病原体从动物转移到人被称为人畜共患传播。这个过程也是发生在实验室之外可能是在与受感染动物密切接触或被食用时。
第二种假设认为，对冠状病毒进行了有目的的基因改造，产生了一种更具传染性和可在人类传播的变种，然后泄露到社区中。这种类型的基因修饰被称为功能获得，因为经过工程改造的病毒获得了新的生物学特性。
武汉病毒学研究所是否对蝙蝠的SARS-CoV-2病毒进行了GoF实验?如果是的话，这可能会引发Covid-19大流行。https://t.co/jmLXhCW4DX
-福布斯科学2021年6月14日
不幸的是，这些假说在某种程度上被误认为是等价的，并经常被描述为“自然起源”假说的替代品。
当我和其他计算生物学家想到起源时，我们想到的是进化祖先:病毒的进化血统。如果SARS-CoV-2是在没有人类干预的情况下从一个或多个宿主中发现的祖先变体进化而来的，那么这种宿主动物或受感染宿主动物的样本很可能是实验室的研究对象。
经过一些不幸的不幸，实验室里有人被感染了是有可能的。
为什么调查很重要
支持或反对这些假设的论据通常以可能性的形式表达。今年2月，世界卫生组织(WHO)在其报告中列出了四种情况全球SARS-CoV-2起源研究:人兽共患病的直接传播、通过中间宿主的人兽共患病的间接传播、通过冷藏/食物链产品的传播以及实验室意外释放。
通过中间宿主的间接人畜共患病传播被认为“非常有可能”，而实验室意外释放“极不可能”。世卫组织专家组拒绝了故意的功能获得操纵，因为它“已经被其他科学家在基因组分析后排除”。
但这并不是最后一句话，因为COVID-19病毒的确切起源仍然是一个谜。
SARS-CoV-2的基因组测序显示，该病毒(约96%)与甲型h1n1流感有关在马蹄蝠中发现的菌株．虽然这似乎是高度相似的，但它意味着SARS-CoV-2从这个菌株中分离出来的几十年前。因此，目前尚不清楚这种溢出效应是直接影响到人类还是通过中间物种。
无论如何，这种进化分析无法区分实验室内外的传播。
世卫组织专家组认为，由于武汉实验室严格的生物安全协议，实验室获得性感染极不可能发生。但英国生物安全协会的数据库列出了即使在具有最高生物安全认证的实验室也会发生的意外感染，其中包括sars冠状病毒感染。
在支持和反对实验室意外释放的论点中，世卫组织报告指出，武汉实验室于2019年12月初转移到华南市场附近的新地点，但“没有报告称此举造成干扰或事件”。我们没有理由不相信世卫组织专家组的结论，但实验室搬迁确实为错误提供了机会。
实验室泄露的假设至少是合理的，因此调查它很重要。如果是和实验室的运作，或者搬迁有关，我们需要重新检查安全协议。对于搬迁，我们可能需要对重要人员进行独立监测和搬迁前后的隔离。
