Cell-type-specific了解冠状动脉疾病的危险因素的函数
使用单个细胞技术,一项新的研究揭示了遗传危险因素的重要性,参与细胞的多样性,冠状动脉疾病的发展。研究人员分析了人类动脉粥样硬化病变地图超过7000细胞的染色质的可访问性。染色质的可访问性是反映活跃地区和基因组中基因。研究结果发表在循环研究。
人类基因组的全基因组关联研究已经确定了超过200个基因座与冠状动脉疾病有关。超过90%的人都是蛋白质编码基因之外,在所谓的顺式元素,其意义在冠状动脉疾病的发病机制尚不清楚。
先前的研究已经表明,冠状动脉疾病的发展涉及到各种各样的细胞及其亚型。现在出版的研究是第一个使用单一细胞技术映射这些细胞表观遗传变化。研究人员使用ATAC-seq测序方法发现核内皮细胞和平滑肌细胞的染色质结构,以及免疫系统单核细胞、巨噬细胞、NK / T细胞和B细胞,提供一个独特的资源研究疾病特异性基因的活动元素影响血管壁。
研究表明,遗传变异与冠状动脉疾病的风险在顺式元素特定于内皮和特别丰富平滑肌细胞,表明这些细胞发挥重要作用在传输对疾病的易感性。根据染色质映射和可访问性基因表达数据,研究人员能够识别假定的目标大约30%的所有已知的基因位点与冠状动脉疾病有关。此外,研究人员进行全基因组实验变异的精细定位,使他们能够识别潜在的因果单核苷酸多态性和相关目标30多个基因位点与冠状动脉疾病。这项研究还提出了一系列的例子如何染色质可访问性和基因表达数据可用于预测靶细胞通过它的功能与疾病相关的基因变化传播的组织。这是向前迈出的重要一步,有助于理解风险的真正功能意义变异在冠状动脉的病理生理学疾病。在未来,这些信息可用于开发更有效、更安全、更个性化的治疗冠状动脉疾病。
进一步探索
更多信息:Tiit奥德et al,单细胞表观基因组学和功能动脉粥样硬化GWAS位点的精细定位,循环研究(2021)。DOI: 10.1161 / CIRCRESAHA.121.318971
期刊信息:
循环研究
所提供的东芬兰大学
引用细胞类型特异的洞察的作用:在冠状动脉疾病的危险因素(2021年7月8日)2022年6月6日从//www.pyrotek-europe.com/news/2021-07-cell-type-specific-insight-function-factors-coronary.html获取
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