治疗COVID-19特制药物提供新的策略
一个联合研究小组从韩科院和巴斯德研究所朝鲜已经确定的特制药物治疗COVID-19通过虚拟筛选和细胞化验。研究小组建议虚拟筛选的策略大大减少假阳性通过合并pre-docking过滤基于形状相似性和post-docking过滤基于交互相似。这个策略将有助于制定COVID-19和其他抗病毒药物治疗疾病更快。本研究报道美国国家科学院院刊》上美利坚合众国(PNAS)。
研究人员筛选6218种药品从fda批准的药物或集合在临床试验和确定38潜在药物重新推向COVID-19这一策略。其中,7个化合物抑制SARS-CoV-2复制州立细胞。三种药物,大黄素、omipalisib tipifarnib,显示anti-SARS-CoV-2活动在人类肺细胞,Calu-3。
药物再利用是一个实用的战略发展抗病毒药物在很短的时间内,特别是在全球大流行。在许多情况下,药物再利用始于批准药物的虚拟筛选。然而,虚拟筛选的实际命中率很低,大部分的预测候选药物假阳性。
研究小组开发了有效过滤算法前后对接模拟提高命中率。在pre-docking过滤过程中,化合物与已知活性化合物的形状相似靶蛋白被选中,用于对接模拟。post-docking过滤过程中,确定的化学物质通过他们的对接模拟评估考虑到对接能源和protein-ligand的相似性与已知的活性化合物。
的实验结果表明,虚拟筛选策略达到很高的命中率为18.4%,导致7个潜在药物的鉴定出38个药物最初选择。
“我们计划进行进一步的临床试验优化药物浓度的三位候选人没有解决毒性问题在临床前试验,”吴Dae张成泽说,韩科院的研究人员之一。
“这个研究最重要的部分是我们研发平台技术,可以快速识别COVID-19治疗的新化合物。如果我们使用这个技术,我们将能够迅速应对新传染病冠状病毒的变体,“特聘教授唱歌是的Lee说。
