免疫反应SARS-CoV-2变异研究

免疫反应SARS-CoV-2变异研究
T-CoV的web界面。(A)顶部的页面包含SARS-CoV-2变种名称、蛋白质含量突变的列表,简短的介绍和两个导航面板:通过病毒蛋白和HLA等位基因不同。(B)单一突变分析包括两两序列比对的一个片段(参考变体和考虑的变体)和一个表HLA-peptide交互影响的突变分析。(C) Allele-specific不同t细胞抗原表位的数字参考病毒变体的考虑(情节是三角洲构造变异)。左面板代表肽的绝对数量,而右边的面板代表比例的紧HLA-peptide交互(绝对数量相对于参考immunopeptidome tight-binders)的数量。信贷:DOI: 10.1093 / nar / gkab701

HSE大学的研究者们评估了t细胞免疫反应的有效性SARS-CoV-2 11变体。研究人员用他们的结果发展门户(T-CoV) t细胞COVID-19地图集。研究结果已发表在核酸的研究

不断出现新的SARS-CoV-2突变允许更有效地传播和逃避抗体。然而,目前尚不清楚新菌株能够逃避t细胞免疫的身体的防御COVID-19的主要线路。

t细胞的发展在很大程度上是由,包括变异基因的主要组织相容性复合体(也称为HLA)。每个HLA基因变体都有一个相应的分子标识一组特定的肽(蛋白质)的病毒。有大量的这样的基因变异,和每个人都有一组独特的。

t细胞免疫的发展的有效性COVID-19因人而异。根据HLA分子的集合,有些人的免疫系统会识别和摧毁一个变异病毒相同的功效,因为他们将病毒的基本形式。别人的反应就没那么有效了。

这项研究是由一群科学家从HSE大学学院的生物学和生物技术和有机化学研究所的俄罗斯科学院,包括斯捷潘Nersisyan,安东Zhiyanov,马克西姆Shkurnikov,亚历山大Tonevitsky。他们评估了基因功能的t细胞免疫的发展到11主要SARS-CoV-2变体通过分析最常见的HLA基因变异。研究人员用他们的结果发展t细胞COVID-19 Atlas门户(T-CoV,https://t-cov.hse.ru)。

研究人员使用生物信息学评估的结合亲和力HLA分子变化和成千上万的病毒肽的主要SARS-CoV-2变体(α、β、γ、δε,ζ,η,θ,极微小,卡帕和λ)。团队确定HLA等位基因显示最显著改变的识别病毒多肽。科学家认为,基因突变可能与这些等位基因对人构成风险更高。

”t细胞免疫的变化和t细胞受体HLA分子阻止病毒逃避免疫应答。我们的研究没有发现一个HLA基因型病毒变异显著负面影响的方法。这意味着,即使在条件降低抗体的有效性,t细胞免疫继续有效运作,”院长说亚历山大·Tonevitsky HSE大学生物学和生物技术学院。

更多信息:斯捷潘Nersisyan et al, T-CoV:综合门户HLA-peptide交互影响SARS-CoV-2突变,核酸的研究(2021)。DOI: 10.1093 / nar / gkab701

期刊信息: 核酸的研究

由国家研究大学高等经济学院提供
引用:免疫反应SARS-CoV-2变异调查(2021年8月16日)检索2023年5月6日从//www.pyrotek-europe.com/news/2021-08-immune-response-sars-cov-variants.html
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