新COVID-19研究者确认速度、简单性和敏感性测试
英国的伯明翰大学的研究人员,证实了速度、准确性和简单的小说,COVID-19高度敏感的测试方法,可以部署在娱乐场所,机场到达终端,在临床实验室的远程设置不可用。
科学家们使用三种方法比较研究确认指数扩增反应(EXPAR)方法是敏感的,但速度更快,比PCR和灯测试目前在医院使用。伯明翰COVID-19测试名为RTF-EXPAR给sample-to-signal下10分钟的时间,即使对于病毒含量低,电流侧流试验更有效。
从生物科学学院教授Tim Dafforn,吉姆•塔克学院的化学与杰克卡特,研究生和教授Andrew begg癌症基因组科学研究所的研究,发表在今天PNAS。
检测病毒RNA PCR和灯测试,可以在极低的水平拭子从嘴巴和鼻子。这些测试使用两步的过程包括第一转换RNA, DNA(这一过程被称为逆转录),然后“放大”多次的物质,因此它可以检测到的样品。
蒂姆Dafforn教授说:“逆转录和扩增步骤减缓现有COVID基于核酸检测,检测抗原测试相比,如横向流,没有这些步骤。然而,尽管这使得横向流测试速度比那些基于PCR和灯,他们通常不敏感。一个理想的测试将是一个既足够敏感,speedy-our测试,称为RTF-EXPAR,达到这一目标。
RTF-EXPAR实现这一壮举在两个ways-firstly分析团队设计了一个新的RNA-to-DNA转换步骤,避免了反转录,这使得反向transcription-free (RTF)。其次他们放大一步生成使用EXPAR读出信号,另一种DNA PCR扩增过程和灯。
Dafforn教授补充道:“EXPAR放大DNA在单一温度,从而避免长时间的加热和冷却步骤PCR中找到。然而,尽管灯还使用一个温度为放大,EXPAR是一个更简单和更直接的过程,小股的放大。这使得EXPAR更快DNA扩增技术不仅PCR,而且灯。”
研究显示,RTF-EXPAR方法将在10股RNA转换成数十亿份DNA在10分钟,用一锅法测定兼容更基本,台式设备比使用当前的测试方法。
RTF-EXPAR还演示了明显改善了PCR和lamp检测信号检测。在低浓度的RNA(7.25 /µL副本),信号检测的时候是42.67(±0.47)分钟PCR, 11.25(±0.20)分钟灯,EXPAR 8.75(±0.35)分钟。在高(1450册/µL)浓度的病毒RNA,信号检测的时候是34.00(±0.00)分钟PCR, 11.25(±0.20)分钟灯,EXPAR 3.08(±0.42)分钟。
识别最优序列的发展显然是一个重要的一步EXPAR方法,和序列检测到在这项研究中,来自于Orf1ab基因在SARS-CoV-2基因组中,已被证明在所有当前的COVID变异是守恒的。然而,RTF-EXPAR方法可以迅速适应新的变体出现,或用于测试其他病毒性病原体如流感、呼吸道合胞体病毒(RSV),或埃博拉,near-patient测试是需要防止更广泛传播。
分析被测试在外科伯明翰大学的研究实验室。教授安德鲁•贝格斯说他的团队进行了测试,评论道:“测试用棉签包含典型的病毒载量在大流行期间,得知,截止时间。灵敏度分析显示RTF-EXPAR相当于定量PCR检测,阳性预测值为89%,阴性预测值为93%。我们希望发布这个试验的全部结果在不久的将来。”
这个团队现在正寻找商业合作伙伴快速的许可,使RTF-EXPAR测试可用尽可能广泛。
