新工具计算T细胞快速帮助预测患者对癌症治疗的反应

伦敦大学学院(UCL)和伦敦弗朗西斯克里克研究所(Francis Crick Institute)的科学家们开发了一种新工具，可以快速估计癌症肿瘤中T细胞(免疫细胞)的数量;由于T细胞的丰度有助于预测患者对免疫治疗的反应，研究人员希望这能实现更有针对性和更有效的癌症治疗。

作为英国癌症研究资助的TRACERx项目的一部分，发表在自然,科学家分析了患者癌症肿瘤的DNA测序数据，看看他们是否可以量化样本中T细胞的比例。

在解释这项研究时，通讯作者Nicholas McGranahan博士(伦敦大学学院癌症研究所)说:“DNA测序经常被用于癌症病人的肿瘤进行患者分层，并了解a癌症开发了。

“免疫细胞对控制癌症、影响患者生存和指导治疗非常重要，过去仅从DNA测序数据无法估计。

“我们的目标是探索是否可以开发一种新的方法来阐明免疫细胞直接通过DNA测序，不需要更多的数据。”

DNA测序使科学家能够看到单个肿瘤如何发展的进化史。在这项研究中，他们开发了一种工具(或方法)来“回顾”并计算T细胞“VDJ重组”的水平;这是T细胞中的一个过程，在这个过程中，它们被重新组装或改变，并被赋予工具，使它们能够识别和攻击入侵者。

具体来说，他们发现了一个“信号”，表明T细胞成熟所需的T细胞受体切除圈(TRECs)的缺失，这发生在VDJ重组期间。通过给这种“损失”打分，他们能够准确地估计肿瘤中存在的T细胞数量。

McGranahan博士补充说:“我们表明，这个分数可以用来预测对免疫治疗和免疫逃避机制的反应。

“这个分数也可以应用于从正常血液样本中获得的DNA测序数据，这些数据通常是收集的，但到目前为止还不能系统地分析免疫成分。”

为什么这将有助于免疫治疗

近年来，检查点抑制剂(CPIs)作为一种免疫疗法，已成为治疗多种癌症的革命性疗法。

cpi的工作原理是阻断T细胞产生的检查点蛋白质;这些检查点有助于防止免疫反应过于强烈，有时可以阻止T细胞杀死癌细胞。当这些检查点被阻断时，T细胞可以更好地杀死癌细胞。

目前发现的预测免疫治疗可能成功的生物标志物之一是T细胞的数量。可供cpi适应的T细胞越多，癌症就越多细胞可以被摧毁。

该研究的第一作者、伦敦大学学院癌症研究所高级研究员Robert Bentham博士说:“直接通过DNA测序量化T细胞浸润，可以在不需要额外数据的情况下，更大程度地预测患者对治疗的反应。

“事实上，我们开发的过程可以在不增加时间和成本的情况下完成，超出了标准的DNA测序。

“我们的工具还将使对免疫系统的更多研究成为可能，而不仅仅是在癌症方面。”

科学家们表示，由于该工具目前只用于研究，他们需要进一步开发才能用于临床应用。

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