全基因组测序提高了罕见疾病的诊断，缩短了患者的诊断旅程

世界上第一个科学研究，发表在新英格兰医学杂志该研究表明，全基因组测序(WGS)可以为迄今为止调查的最广泛的罕见疾病的人们发现新的诊断，并可以为整个NHS带来巨大的好处。

这项针对罕见未确诊疾病的初步研究分析了来自2183个家庭的4660人的基因，这些人都是该研究的早期参与者10万基因组计划．这个开创性的项目由英国基因组公司和英国国民医疗服务体系(NHS)领导，于2013年成立，对NHS患者及其家人的10万个全基因组进行测序。

这项试点研究由英国基因组学公司和伦敦玛丽女王大学领导，并与国家健康研究所(NIHR)生物资源合作进行，发现使用WGS对25%的参与者进行了新的诊断。在这些新诊断中，有14%是在其他常规方法(包括其他类型的非全基因组检测)可能遗漏的基因组区域中发现的。

许多参与者经历了多年的约会，却没有得到任何答案。通过他们的全基因组发现了以前无法检测到的测序诊断。初步研究表明，WGS可以有效地为患者提供诊断，节省NHS的重要资源，并为其他干预措施铺平道路。

通过试点获得诊断的参与者包括:

• 一名10岁女孩在此前7年的时间里一直在寻找诊断，她多次接受重症监护，住院次数超过307次，花费了356,571英镑。基因组诊断使她能够接受治疗性骨髓移植(花费7万英镑)。此外，对她的兄弟姐妹进行的预测测试显示，没有其他家庭成员有患病风险。
• 一名60多岁的男子患有严重的肾脏疾病，忍受了多年的治疗，包括两次肾脏移植。在知道他的女儿遗传了同样的疾病后，通过观察他和女儿的整个基因组做出了基因组诊断，使他15岁的孙女能够接受检测。这表明她并没有遗传这种疾病，可以停止定期昂贵的检查。
• 一名婴儿出生后立即患上重病，四个月大时不幸死亡，但没有得到诊断，医疗费用高达8万英镑。对他整个基因组的分析发现，由于无法在细胞内摄取维生素B12，他患有严重的代谢障碍。这使得他的弟弟在出生后一周内就能接受预测测试。年幼的孩子被诊断出患有同样的疾病，但可以每周注射维生素B12来治疗，以防止疾病的恶化。

大约四分之一的研究参与者，他们的诊断意味着他们能够接受更集中的临床护理。这包括进一步的家庭筛查、饮食改变、提供维生素和/或矿物质以及其他疗法。

这项研究首次分析了WGS对国家卫生保健系统中广泛罕见疾病的诊断和临床影响。研究结果支持了其在全球卫生系统中的广泛采用。

在初步研究中观察到WGS对特定疾病的高性能(包括智力残疾、视力和听力障碍的诊断率为40-55%)，这为将WGS用于诊断特定罕见疾病作为新标准的一部分提供了依据NHS国家基因组检测目录．

这项试点研究还与国家卫生研究所(NIHR)和Illumina合作进行，后者进行了测序，由NIHR、威康信托基金会、医学研究理事会、英国癌症研究中心、卫生和社会保障部以及英国国民医疗服务体系资助。bob88体育平台登录

来自伦敦玛丽女王大学的Mark Caulfield教授(第一作者)、英国基因组学公司的前首席科学家说:“我们希望这一重大进展将使世界各地的罕见疾病患者开始在适当的时候接受诊断性全基因组测序。我们的研究结果表明，在症状的最初迹象时部署这种全面而有效的基因组测试，可以提高诊断率。这项研究为全基因组测序作为NHS基因组医学服务的一部分的临床实施铺平了道路。”

来自伦敦玛丽女王大学的Damian Smedley教授(主要作者)说:“这是全基因组测序首次直接嵌入到NHS等医疗保健系统的罕见病诊断中，并大规模应用于罕见病的全部范围。我们的新软件，以及详细的临床数据的收集，是我们能够解决“大海捞针”挑战的关键，即在每个基因组的数百万个变异中找到罕见疾病患者病情的原因。我们发现的大部分诊断是在编码区之外发现的，用现有的方法是检测不到的。这项研究为全球医疗保健系统采用全基因组测序作为罕见病例的基因检测选择提供了依据疾病病人。”

英国基因组学参与者小组主席Jillian Hastings Ward说:“在这项试点研究中注册全基因组测序的人希望为他们所爱的人找到新的诊断方法，并愿意与英国基因组学分享他们宝贵的数据，以便更好地了解罕见疾病。试点在这两个方面都有所帮助，我们很高兴全基因组测序现在正由NHS常规提供给英格兰更多的家庭。这是一个巨大飞跃的开始，它需要家庭、临床医生和研究人员继续共同努力，以充分发挥其潜力。”

Genomics England的首席医疗官Richard Scott博士说:“从历史上看，罕见疾病的诊断通常依赖于临床医生进行多种不同的靶向检测，这种方法可能会延迟诊断和获得更有针对性的治疗。政府和NHS投资的基因组学知识和全基因组测序以及数据基础设施的改进，现在为我们提供了从根本上改变这一过程的能力。本文提供了这种转变的证据，以及它在哪里产生了最大的影响。我们英格兰基因组公司很自豪能与英国国家医疗服务体系合作，为所有人带来好处基因组对患者进行测序。”