综合multi-omics分析在慢性淋巴细胞白血病分类不同的致病过程

综合multi-omics分析在慢性淋巴细胞白血病分类不同的致病过程
图1:成分和慢性淋巴细胞白血病亚型在集群数据的关系。分析,识别示意图表示的慢性淋巴细胞白血病亚型CLL8,达到队列和确认。四大集群(GI,(我)胃肠道,EMT-L,(我)EMT-L),和协会的NRIP1炎症或三(12)EBF1-r签名也独立验证队列中标识的审判。Co-clustering GI / (I)的胃肠道和EMT-L / (I) EMT-L病例达到队列支持治疗期间subgroup-specific特征的选择。b的热图显示共识集群k = 6用于定义慢性淋巴细胞白血病亚型(n = 337)。基因的分布特点如下所示的热图。重要变量浓缩在集群观察德尔(17页)(p = 0.05), TP53突变(p = 0.01),三(12)(p = 7 e−06),德尔(13)(p = 0.03),和IGHV突变状态(p = 0.008)(所有确切概率法(双边))。TP53移码突变发生只在胃肠道和剪切位点突变EBF1-r病例。三(12)强烈在资料库EBF1-r (72.7%)。c端粒长度在慢性淋巴细胞白血病亚型明显不同(p < 0.001,克鲁斯卡尔-沃利斯检验),和最短长度是在胃肠道中位数为3.8 kb (p = 0.003, Mann-Whitney(双面),对胃肠道和(我)EMT-L) (n = 333)。 d White blood cell counts are significantly different across CLL subtypes (p < 0.0001, Kruskal-Wallis test), show decreased counts in inflammatory CLL and are lowest in (I)EMT-L with median 61.1 G/L (p < 0.0001, Mann–Whitney (two-sided), for GI vs. (I)EMT-L) (n = 330). For Fig. 1a–d, data within individual figures derives from biologically independent samples. For the boxplots, centerline, box limits, and whiskers represent the median, 25th, and 75th percentiles, and 1.5× interquartile range, respectively. Credit: DOI: 10.1038/s41467-021-25403-y

一个国际研究小组的研究人员现在已经全面异形和超过700个肿瘤样本分类患者慢性淋巴细胞白血病(CLL)通过分析多级编码的生物信息。

通过详细的映射派生信息,他们确定了主要生物类别与不同的电阻不同治疗模式的组合。

除了变化表明异构水平的炎症活动,基因组不稳定性的程度是主要的歧视性功能子组的肿瘤。

,高水平的基因组不稳定性增加的可能性改变基因组中,很大程度上取决于肿瘤功能来识别和修复dna损伤。

基因组不稳定性在慢性淋巴细胞白血病相关基因突变或染色体的损失区域编码细胞基因组保护观察人士,所谓的肿瘤抑制基因。

肿瘤表现出肿瘤抑制基因的失活通常有一个糟糕的结果和早期检测有助于选择最适当的治疗。然而,基因组不稳定性也出现在许多慢性淋巴细胞白血病病例没有检测到变化。

据约翰Bloehdorn(乌尔姆大学)和他的同事们自然通讯、肿瘤样本分析包括评估的基因突变,,基因和dna甲基化和相关pathway-signaling活动。

作者能够解码肿瘤生物学和翻译基础信息的方式可以对肿瘤进行分类无论检测损失或肿瘤抑制基因或dna修复基因的突变。

作者进一步发现,基因不稳定的肿瘤不仅关闭了DNA修复,但显示了和非常容易出错的维修活动。这进一步增加积累的基因改变,加速发展的阻力。

另一个主要小组发现在这项研究中,显示的最低程度、展品特点在实体肿瘤转移的过程中,观察到以前不知道在慢性淋巴细胞白血病建立subgroup-specific功能网络。

慢性淋巴细胞白血病细胞可以通过血液到达身体的任何部分。因此,出现冗余的发展机制,使细胞从肿瘤打破寻找更好的生存的利基,表示通过在实体肿瘤转移的过程。

然而,这些发现可能会增加网络的能力对白血病细胞退出血液和迁移到淋巴组织。几个有针对性的治疗方法解决相关的机制和细胞在淋巴器官中积累的能力。

现在建立了肿瘤分类是一个重要的进步在理解基础生物学、耐药机制,最终可能改善慢性淋巴细胞白血病的预后模型个性化的治疗方法,甚至其他肿瘤实体。

更多信息:约翰内斯Bloehdorn et al,多平台分析特征分子子组和电阻网络在慢性淋巴细胞白血病,自然通讯(2021)。DOI: 10.1038 / s41467 - 021 - 25403 - y

期刊信息: 自然通讯

由乌尔姆大学
引用:综合multi-omics分析分类不同的致病过程在慢性淋巴细胞白血病(2021年12月6日)检索3 2023年5月从//www.pyrotek-europe.com/news/2021-12-comprehensive-multi-omics-analysis-categorises-distinct.html
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