癌症-免疫:预测免疫检查点阻断免疫治疗反应的数据门户

范德比尔特大学医学中心生物统计学家团队建立了一个名为cancer - immune的新数据门户，可以帮助癌症临床医生和研究人员预测哪些患者会对免疫检查点抑制剂产生反应。cancer - immunu拥有来自16种癌症类型的3652个样本的数据，是探索免疫基因组联系的最大的免疫检查点封锁相关数据门户。

该团队在12月13日发表的一篇论文中提供了开放访问门户的详细信息癌症研究．cancer - immune整合了大规模的多维组学数据，包括遗传、体、单细胞转录组、蛋白质组和动态基因组图谱。它还整合了临床表型。

虽然免疫检查点抑制剂可以挽救一些癌症患者的生命，但大多数患者对免疫疗法没有反应。研究人员正在努力识别预测反应的生物标记物，cancer - immune为解开免疫-基因组之间的联系提供了一个全面的功能入口。

VUMC生物统计学系主任、癌症研究Harold L. Moses主席、该论文的高级作者之一Yu Shyr博士说:“它提供了获取免疫原性数据的简便途径，并使研究人员能够将组学数据集转化为生物学见解和临床应用。”生物统计学副教授、论文另一位资深作者刘琪博士表示:“与现有的免疫检查点封锁反应结果数据库相比，cancer - immunu覆盖了最多的数据集和组学数据类型。”

的癌症在数据门户包括黑色素瘤，非小细胞肺癌转移性尿路上皮癌，肾细胞癌，膀胱癌神经胶质瘤,结肠直肠癌头颈癌、食道胃癌、原发原因不明的癌症、胃癌、乳腺癌、肝细胞癌、前列腺癌、基底细胞癌、非黑色素瘤皮肤癌。

通过cancer - immunu门户，临床医生和研究人员可以上传和分析他们自己的数据，或者与现有数据同时进行协同分析。他们可以使用元分析或泛癌症分析。该门户拥有三种类型的组学数据:遗传、转录组学和单细胞数据。泛癌症模块将多个数据集聚合为一个，增强了罕见特征的检测和分析。生物统计学家在研究中指出，尽管荟萃分析针对同一问题的独立研究的统计评估未能检测到显著的基因突变，泛癌症分析，这是对多种癌症类型更广泛的评估，检测到182个基因的突变与免疫检查点抑制剂显著相关。

该研究的第一作者、薛尔研究实验室博士后杨静博士说:“cancer - imu有助于解决已知生物标记的有效性评估和新签名发现方面的不足和挑战。”

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