全基因组测序可以检测最常见的遗传性神经疾病
科学家们发现，全基因组测序(WGS)可以快速准确地检测出最常见的遗传性神经疾病——这在以前被认为是不可能的——结果支持将WGS作为常规临床实践中的标准诊断工具。
这项研究今天发表在《柳叶刀神经病学》-由伦敦玛丽女王大学、Illumina、伦敦大学学院和英国基因组学与英国国民保健服务联合领导，并评估了WGS的诊断准确性与NHS标准使用的测试。
这项研究评估了WGS在最常见的遗传原因中的作用神经系统疾病这通常需要多次测试，这个过程会导致漫长的诊断过程。这些重复扩张障碍具有短的重复DNA序列，可引起诸如脆性X综合征(智力残疾)、亨廷顿舞蹈病、弗里德赖希共济失调(FA)和某些形式的肌萎缩性侧索硬化症(ALS)和额叶或额颞叶痴呆(FTD)等疾病。
该研究首先分析了WGS检测重复扩张障碍的准确性，通过比较目前使用的PCR(聚合酶链式反应)测试，与先前在NHS测试的404例患者的WGS。研究结果强调，WGS检测这些疾病的准确性和敏感性与使用PCR检测相当。
然后，该研究使用了11631名患有重复扩张障碍相关临床特征的未确诊患者的WGS，这些人都是10万人基因组计划的参与者。在68名受益于诊断的人中，有6名儿童，其中一些人没有重复扩张障碍的家族病史，以前也没有接受过诊断，包括一名患有智力障碍的10岁女孩和一名患有痴呆症的18岁青少年。
该研究表明，通过这种方法可以实现更快、更有效的诊断全基因组分析那些以前没有接受过诊断的患者，取代了几个月或几年的多次检查。
这是因为PCR测试通常是位点特异性的，这意味着每次只检查一个基因。这个过程很耗时，而且会导致那些有非典型临床表现的人诊断不足，尤其是以前没有阳性家族史的儿童。相比之下，一次WGS测试可以诊断许多疾病。
该研究结果支持在NHS内使用全基因组测序来诊断医生认为可能患有重复扩张障碍的患者。这样做的好处包括:
- 为以前未确诊的病症提供答案
- 亲属知道这种遗传病在家族中遗传
- 提高了对基因突变在人群中出现频率的理解
- 临床药物/治疗试验增加
伦敦玛丽女王大学教授、英国基因组学公司前首席科学家马克·考尔菲尔德爵士说:“这代表了全基因组应用的重大进步，使以前意想不到的遗传性神经疾病得以检测。”目前，诊断这种类型的神经障碍通常取决于有这种疾病的家族史或特定的临床症状的人，使用WGS我们可以检测出这些和新的重复扩张障碍。”
伦敦玛丽女王大学和伦敦大学学院医学研究bob88体育平台登录委员会临床科学家研究员Arianna Tucci博士说:“重复扩张障碍估计会影响1/3000人。在这项研究之前，人们认为很难用全基因组测序来诊断他们。我们的研究验证了全基因组测序的使用，这是一种新引入的国家卫生服务的基因检测，可以诊断最常见的遗传性神经疾病。”
英国基因组公司的首席医疗官理查德·斯科特博士说:“这是一个明显的例子，我们很自豪地帮助加速了这种创新，以及英国通过将研究与基因组学的常规护理联系起来而能够产生的影响。”这项工作使我们能够部署新的工具，可以检测更有针对性的测序遗漏的基因组变异。在10万基因组计划中，这已经为患有罕见疾病的家庭带来了诊断和更好的护理，并被用于支持NHS基因组医学服务的诊断。”
Illumina科学研究副总裁Ryan Taft博士说:“这项研究表明，全基因组测序可以用于临床实验室，用于诊断患有神经系统疾病的患者，如亨廷顿舞蹈症。对于大部分疑似重复扩张障碍的患者仍未确诊，这应该会带来诊断可能很快成为可能的希望。”
英格兰首席科学官Dame Sue Hill教授说:“这项研究证明了全基因组测序在帮助检测常见神经疾病方面的力量，以及它如何导致更快、更准确的诊断。”通过NHS基因组医学服务，我们已经看到了WGS在临床环境中的好处，这项研究进一步证明了这种测试的好处。”
艾琳是伦敦共济失调中心的一名患者，通过这项研究被诊断出患有弗雷德里希共济失调症，她说:“弗雷德里希共济失调症夺走了我所爱的一切。在过去的15年里，我从一个自信、喜欢跳舞和社交的人，变成了现在用助步器走路、说话含糊不清的人。现在，当我遇到别人时，我马上就会觉得他们可能在评判我。
“在确诊之前，我认为如果我得了癌症会更好，因为通常有一个明确的行动路径来帮助你对抗疾病。确诊并不能治愈，但我终于知道发生了什么，也明白了我需要做些什么，才能尽可能长时间地推迟不可避免的事情。我做普拉提，每周两次和私人教练一起工作，以最大限度地提高我的力量和健康水平，以对抗病情的恶化。我非常感谢伦敦共济失调专家中心，他们的研究项目让我有了一个明确的基因诊断，如果没有他们，我可能需要很多年才能做出诊断。我觉得罕见病患者去正在进行研究的专科中心是有益的。
“同样重要的是，得到确诊意味着我的家人也可以进行基因测试。可悲的是，共济失调中心可以很快确认我的妹妹也患有FRDA，所以她正在尽一切努力对抗进展。
“目前还没有治愈FRDA的方法，但我对未来更加乐观——希望在不远的将来会有一种治疗方法。”
医学研究委员会临床主任帕特里克·钦纳里教授说:“许多患有神经疾病的患者bob88体育平台登录障碍从未得到准确的诊断。这项新研究显示了整体基因组测序可以通过真正的国家计划解决这一挑战，将世界领先的研究成果带给整个英格兰的患者，并改善他们的医疗保健。”
