基因组学研究有助于指导志贺氏杆菌疫苗开发

利物浦大学的领导的新的基因组学研究将有助于指导疫苗的开发和使用全球儿童严重腹泻的主要原因:志贺氏杆菌。

志贺氏杆菌的主要细菌引起严重的儿童腹泻在低收入和中等收入国家(LMICs)和越来越抗菌素耐药。然而,没有许可疫苗广泛使用志贺氏杆菌和发展的主要挑战之一是大量基因和表型多样性的细菌。

在最新发表的一篇论文微生物学性质1246年,研究人员分析了全基因组序列志贺氏杆菌从七个系统地收集的样本中低收入国家的要求”来形容这种多样性,这是至关重要的通知疫苗开发和实现,和其他方面的疾病控制。

无与伦比的样本集合覆盖所有四个志贺氏杆菌物种(s . sonnei s flexneri、鲍氏和痢疾)和收集全球肠多中心研究的一部分(宝石)在2007年和2011年之间。

这项研究强调了病原体的特性,这些特性将使目前的疫苗方法,志贺氏杆菌多样性的地区差异以及抗菌素耐药性的决定因素。

调查结果是志贺氏杆菌sonnei贡献至少6倍比其他志贺氏杆菌物种相对于其疾病基因组多样性,现有的多样性和适应能力在美国flexneri可以生成疫苗逃脱变异在不到六个月。

研究还揭示了抵抗环丙沙星的趋同进化,当前的世卫组织建议的抗菌素治疗志贺氏菌病。

丽贝卡·本特松博士领导了数据分析,说:“病原体基因组学是一个功能强大的工具,已广泛的应用程序来帮助对抗传染病。通过基因组流行病学代表数据集的分析,我们发现志贺氏杆菌人口基因组多样性的程度影响那些最脆弱的志贺氏菌病,这种多样性的影响对当前疫苗策略。”

目前很多疫苗方法关注志贺氏杆菌血清型,但有> 50种血清型在志贺氏杆菌和这些可以改变迅速产生免疫逃避变体。一个有吸引力的替代和/或补充这种方法specific-subunit疫苗这一目标高度保守的蛋白质,可以提供广泛的保护,但是这些目标抗原变异的程度是未知的。本研究探索了抗原变异的数量和类型,他们可以改变血清型的速度。总的来说,结果表明,蛋白质抗原提供更稳定疫苗这个目标在全球重要的病原体。

凯特·贝克博士领导了这项研究,说:“疾病负担和增加AMR志贺氏杆菌呼吁修订的治疗和管理选项,和重要的势头已经建立了这一挑战。志贺氏杆菌的基因组多样性提供了一个主要障碍在控制疾病和我们演示了预期目前的疫苗接种方法的缺陷。这凸显了需要考虑基因的多样性疫苗开发志贺氏杆菌和治疗计划和其他病原体。”