研究人员解决了人类转录因子(TF)调控问题

研究人员解决了人类转录因子(TF)调控问题
研究的TF和TF家族的综合蛋白相互作用。a所研究的TF在内圆中根据其TF家族进行组织和颜色编码(节点颜色),相互作用的蛋白质在外圆中以白色表示。蓝色边表示生物id分析检测到的相互作用,红色表示AP-MS分析,绿色表示两者的相互作用。b BioID和AP-MS检测不同TF家族PPIs的平均数量。需要注意的是,TF族的颜色编码与a)中相同,并且根据BioID数据将TF族组织为3个箱子,第一个箱子有150-100个高可信度交互作用/诱饵TF,第二个100-50个,第三个<50个交互作用/TF。AP-MS检测到的稳定相互作用与相互作用数呈正相关;然而,KLF家族的表现不同,其平均相互作用次数是其他TF家族的2倍多。图的源数据作为Source data文件提供。信贷:DOI: 10.1038 / s41467 - 022 - 28341 - 5

来自赫尔辛基大学的一个研究团队介绍了一项关于人类转录因子的新的大规模研究,结合了两种最先进的相互作用组学方法,允许快速识别蛋白质-蛋白质相互作用和这个重要基因家族的广泛功能信息。

转录因子(转录因子)是细胞发育、分化和维持内稳态最重要的蛋白质群。它们在细胞发育的各个阶段驱动复杂的基因表达模式。TF信号的缺陷往往会导致发育障碍和疾病。

然而,虽然TF DNA结合已经得到了广泛的研究,但我们仍然缺乏系统层面的了解,如何通过与多种蛋白质的相互作用来控制TF活性和信号,如辅因子、二聚体伙伴、染色质调节蛋白、酶、抑制蛋白和一般蛋白

赫尔辛基大学的一个研究小组决定发起一项大型研究,以阐明TF蛋白-蛋白质相互作用和TF调节。这项新研究发表在自然通讯

HiLIFE生物技术研究所的研究主任Markku Varjosalo说:“我们对超过100个TF进行了全面的相互作用组分析,揭示了超过7000个TF蛋白质-蛋白质相互作用,其中大多数在细胞核中,在转录调控中发挥着重要作用。”

研究结果为进一步研究TF调控奠定了基础

本研究中发现的大量TF相互作用使研究人员能够进行系统级的分析,揭示具有特定生物功能的TF组,如染色质重塑和RNA剪接。

“有趣的是,几乎一半被研究的tf与tf的核因子家族相互作用。已知核因子在发育过程中控制着大量的基因和器官发生,它们的异常活动与几种人类癌症类型有关。我们的数据表明,NFIs的转录控制可能是由核因子与其他tf的相互作用调节的,”该研究的第一作者Helka Göös博士说。

该研究首次提供了关于人类转录因子的物理和功能相互作用的全面和补充概述。这些新发现为进一步研究TF调控奠定了基础。

“在过去的10年里,我们的实验室一直致力于识别和研究个体的疾病机制癌症和免疫缺陷的因子突变。tf已被证明是困难的药物目标,然而它们的几个关键监管机构要有希望得多。我们生成的关于tf的大型信息图谱可以作为药物发现研究的丰富资源,以确定对tf相关疾病的药物治疗,”Varjosalo博士说。


进一步探索

成功秘诀:相互作用蛋白质组学成为家庭用品

更多信息:Helka Göös等,人类转录因子蛋白相互作用网络,自然通讯(2022)。DOI: 10.1038 / s41467 - 022 - 28341 - 5
期刊信息: 自然通讯

所提供的赫尔辛基大学
引用:研究人员解决了人类转录因子(TF)调控(2022年,2月9日),从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-02-human-transcription-factor-tf.html检索到2022年10月19日
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