SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合结构域的突变可能产生新的疫苗耐药变体
![Monoclonal antibody-mediated neutralization of SARS-CoV-2: The left panel illustrates the morphology of the SARS-CoV-2 virus and displaying the trimeric spike protein on its surface bound with antibodies. The right panel depicts the zoomed view of the trimeric spike protein (top view) in prefusion state bound with monoclonal antibodies. Each monomer of the spike protein shows the receptor binding domain (RBD) in green, orange and magenta, which contains a receptor binding motif in cyan on the top. Mutations emerged in the SARS-CoV-2 Omicron variants are shown in red. Here, the C309 (a parent of VIR-7831 or Sotrovimab) antibody is shown in blue, which is one of the antibodies in clinical use that is minimally impacted by the Omicron variant mutations. Credit: Piyush Prakash, Anshumali Mittal, Vikash Verma, Arun Khatri (CC BY 4.0, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/) SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域的突变可能导致对治疗方法和疫苗有耐药性的逃逸变异](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2022/mutations-in-sars-cov.jpg)
SARS-CoV-2病毒正在不断进化,病毒结构的变化可能会影响抗体疗法和疫苗的疗效。2月17日发表的一项研究PLOS病原体匹兹堡大学的Anshumali Mittal及其同事描述了对抗SARS-CoV-2刺突蛋白的中和抗体的结构和功能景观,并讨论了病毒刺突蛋白突变的影响,这些影响可能使其逃避抗体反应。
所有病毒在进化过程中都会发生突变,大多数突变对病毒的适应性有负面或中性的影响。然而,一些突变使病毒具有选择性优势,使它们更具传染性,更易传播,并对抗体反应和治疗方法具有抵抗力。为了更好地理解对SARS-CoV-2病毒的免疫反应与突变如何使病毒逃脱中和之间的关系,研究人员对包括大约139项研究在内的文献进行了回顾。他们综合了对新出现的SARS-CoV-2变体的研究,描述了抗体如何中和SARS-CoV-2的结构基础,并绘制出了抗抗体结合和中和的刺突蛋白突变或“逃逸变体”。
研究人员总结了针对抗体的刺突蛋白受体结合域(RBD)的基于结构的分类,以更好地理解中和的分子机制。他们还进一步描述了几种抗体的RBD逃避突变,这些抗体抵抗疫苗诱导的和治疗相关的抗体结合。然而,未来的研究需要更好地了解这些突变如何影响疾病严重程度和死亡率。
根据作者的说法,“治疗性抗体和疫苗的效力部分取决于病毒逃脱中和的难易程度。SARS-CoV-2病毒将继续进化,导致逃逸变体的出现;因此,全球范围的基因组监测,更好的疫苗接种驱动,广泛发展中和抗体新药对抗击COVID-19至关重要。”
Mittal补充说:“基于结构的逃逸图与计算建模相结合,是了解每个残基突变如何影响抗体结合的有价值的工具,并可用于促进抗逃逸抗体疗法、疫苗和其他对策的合理设计。”
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