计算机程序缩小了治疗COVID-19的候选药物

虽然疫苗接种和关于导致COVID-19的冠状病毒传播的公共教育一直是我们应对大流行的首要工作，但在发生感染并导致严重发病率和严重死亡风险的情况下，仍然迫切需要药物干预措施。新工作国际计算生物学与药物设计杂志重点研究了体内的三种蛋白质靶点，这些靶点被认为是感染后病毒在体内繁殖并导致症状的关键。

印度加尔各答大学细胞与分子生物学实验室的Srija Mukherjee和Santanu Paul认为，血管紧张素转换酶-2受体(ACE-2)是小分子药物的一个有前途的靶点。SARS-CoV2进入人类细胞通过位于肺、动脉、肾和肠膜上的ACE-2受体。因此，一种选择性地靶向这种蛋白质的小分子可以用来减少病毒与这些蛋白质的相互作用，从而阻止其感染到复制的周期。

该团队已经转向了一个具有蛋白质目标模型的计算机程序。分子结构候选药物然后与蛋白质模型中的对接位点进行匹配，以确定它们适合该位点的程度以及它们与该位点的结合程度。这种对药物分子的硅片筛选使研究小组能够快速确定10种候选药物中哪一种值得在实验室体外实验中进行，然后将在这些实验中被证明有用的任何药物转移到动物模型中进行体内评估。

在硅测试的主要好处是，任何候选人看起来不太可能对接好靶蛋白可以被丢弃，时间和资源也不会浪费在体内和体外实验上，这些实验很可能会走入死胡同。

因此，该团队已经对10种候选药物与靶蛋白模型进行了硅硅测试。这些药物是联氨嗪，Fostemsavir, Trandolapril, Triamterene, Isuprel，沙丁胺醇，Benadryl, Ro 28-2653，茶碱和甲磺酸Osimertinib。他们确定，一种名为Ro 28-2653的分子在治疗COVID-19方面最有希望。这种化合物的化学名称为5-联苯-4-基-5-[4-(-硝基苯基)-哌嗪-1-基]-嘧啶-2,4,6-三酮，已经被认为是一种药物分子，并已被测试为一种参与癌症肿瘤血管生长的蛋白质的抑制剂。

“我们的研究表明，Ro 28-2653可能是一种强有力的抑制剂预防COVID-19，”该团队写道。他们指出，这种药物难溶于水，因此需要一种载体，比如环状的“淀粉”分子环糊精，才能口服。然而，这种药物有一个重要的优势，即一旦被吸收，它在体内的半衰期很长，因此有望在很长一段时间内保持对抗病毒的活性。事实上，因为它针对的是体内的一种蛋白质，所以它应该对任何现有或新型冠状病毒菌株都有活性。

下一步将是将硅内实验进行到体外水平，以观察药物在实验室中是否对靶蛋白有效。