科学竞赛来理解欧米克隆的变种

去年年底，初步研究显示，快速传播的omicron SARS-CoV-2变体可能会躲过COVID-19抗体，但在许多人身上，这种情况比预期的要少。现在，卡罗林斯卡学院的一项研究已经发表在该杂志上《柳叶刀传染病》．KI研究员本·莫雷尔解释了这一发现，并回忆了当时急于了解这种新变种的情形。

2021年11月底，一种新的SARS-CoV-2变体是由南非的科学家发现的，后来被称为ο．在病毒迅速传播的早期信号之外，欧米克隆的刺突蛋白(中和抗体所针对的部分)上的突变数量也引起了国际社会的警觉。这引发了一场科学研究的热潮，即描述欧米克隆能在多大程度上避开中和抗体。

“这些天，我们通常使用基因合成来创建新的刺突基因来测量抗体中和，”本·莫雷尔说，他是卡罗林斯卡学院微生物学、肿瘤和细胞生物学系的助理教授，也是该研究的最后一位作者。

当变种的消息第一次传出时，本·穆雷尔下了一个合成订单。然而，在这之后不久，病例开始出现在欧洲，本·穆雷尔的实验室意识到可能有一种更快的方法来创建一种ommicron中和试验。

通过与Jan Albert教授的合作，Ben Murrell的实验室从疑似的ommicron感染中获得了匿名样本。Jan Albert教授一直在瑞典对SARS-CoV-2变种进行测序。他们能够将穗状基因中含有小粒突变的部分克隆到用于中和试验的穗状主干中。

以极快的速度移动

“丹尼尔·谢沃德(Daniel Sheward)在我的实验室里进行这些化验，他的速度特别快。我们能够在获得该样本的8天后发布第一个中和结果，这距离向世界卫生组织报告该变异仅13天。”本·穆雷尔说。

当研究人员接近最后一步时，他们联系了在南非的同事，他们也在研究这种新变体，但采用了不同的方法。

本·穆雷尔说:“南非的实验室从一开始就获得了欧米克隆样本，并试图在实验室中培养活的欧米克隆病毒，并用它来测量中和作用。”“他们告诉我们，他们也在和我们几乎同时得出初步结果，所以我们决定比较一下意见，然后立即发布数据。”

但是，当他们对比意见时，南非的结果看起来不同。南非的数据显示，与来自斯德哥尔摩的两个队列的数据相比，抗omicron抗体的中和损失要大得多。斯德哥尔摩的研究结果还表明，损失是非常可变的，一些人中和欧米克隆的效果几乎与他们中和最初的SARS-CoV-2变体一样好，但另一些人对欧米克隆失去了很多效力。

迫切需要答案

“最初的差距让人非常头疼。这是一个需要快速回答的重要问题，但对于这个答案的正确来说绝对是至关重要的，”本·穆雷尔解释道。

实验室在接下来的几个小时里尽可能地反复检查所有的东西，然后公开发布了他们的数据，并对类似这样的初步结果提出了适当的警告。在接下来的几天或几周内，其他实验室开始发布数据。

“画面变得非常清晰。交叉中和omicron的能力似乎很大程度上取决于你的免疫系统暴露于SARS-CoV-2峰值的次数，无论是通过感染还是通过接种，”本·穆雷尔解释说。

这就是为什么来自斯德哥尔摩医院工作人员的先前感染并接种了疫苗的队列的数据显示出比在南非研究的队列更多的omicron交叉中和。

“有趣的是，随机选择的瑞典献血者也表现出大量的ommicron中和——没有医院工作人员那么多，但比我们最初预期的要多，”Ben Murrell补充说。

几天后，该实验室公布了用于治疗COVID-19的临床相关单克隆抗体的中和数据。这些结果表明，许多治疗性抗体被欧米克隆无效。其中，Sotrovimab对omicron保留了大部分效力，而omicron与Sotrovimab的开发人员刚刚公布的数据一致。本·穆雷尔警告说:“我们的数据来自BA.1的omicron谱系，这在当时占主导地位，但来自其他实验室的最新数据显示，在全球范围内超过BA.1的BA.2在这里似乎有所不同。”

疫苗接种问题

该出版物记录了这些初步结果，并增加了一些数据，增加了随机献血者队列的规模，其中图片没有变化，并包括在接种疫苗前采集的先前感染的样本。

“这些受感染但未接种疫苗的样本显示对omicron的中和作用完全丧失，这表明你不能依赖自然感染来产生对这些更突变的变种的良好抗体，你必须接种疫苗，”Ben Murrell说。“我们在被感染后接种疫苗的人身上看到的交叉中和随后被证实也发生在接受第三剂强化疫苗的人身上。”

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