研究人员识别tumor-based甲基化模式作为癌症生物标记
生物标志物通常使用在治疗癌症的管理来指导决策和预测病人的结果。然而,往往很难确定合适的生物标志物可以持续复制,很容易分析有限的病人标本。在一项新的研究中出现在5月1日出版的《华尔街日报》的封面癌症研究莫菲特癌症中心研究人员日前称,他们识别基于一种基因改良的生物标记物称为甲基化预测肿瘤免疫微环境的类型和患者的结果。
基因是高度受特定的修改,可以促进或阻碍他们的表情。一种表观遗传修饰称为甲基化涉及附件甲基化工集团的特定区域的基因。一般来说,更高水平的甲基化在基因启动子区域往往是与基因表达水平较低有关。最近的研究表明,基因甲基化的模式可能是潜在的生物标记物。使用甲基化的生物标志物在常用的基因表达标记有几个优点,包括再现性和稳定性,使它很容易使用吗临床的设置,更少的变化在不同的测试技术,能够使用组织标本,冷冻或固定在甲醛和嵌入石蜡。
目前,细胞溶解的活动分数是一个行之有效的生物标志物和预测基于基因表达的肿瘤浸润淋巴细胞的存在。肿瘤浸润淋巴细胞是一种免疫细胞,搬出去的血液和肿瘤。中存在大量的肿瘤浸润淋巴细胞肿瘤通常是与改善病人预后。细胞溶解的活动分数预测肿瘤浸润淋巴细胞的存在,特别是细胞毒性T细胞,通过测量基因表达模式。
莫菲特在他们的研究中,研究人员想要确定一个更好的比常用的生物标志物,如溶细胞的活动分数(对于识别热/冷肿瘤)。他们提议tumor-based表达式定量的概念特征甲基化相关基因甲基化与基因表达模式,识别潜在的生物标记物。研究人员专注于黑色素瘤疾病模型,评估是否可以识别一个特定的甲基化签名可以预测肿瘤的免疫微环境是什么样子的,病人的结果。
黑素瘤的研究团队发现甲基化序列样本可以作为代理为溶细胞的活动评分和预测生物标志物在肿瘤免疫环境的类型。进行更有针对性的分析,确定一个基因的甲基化名为TCF7可以预测是否T细胞在肿瘤的抗肿瘤特性,他们发现TCF7签名结合细胞溶解的活动评分预测病人的结果。具体地说,黑色素瘤患者低TCF7签名和高溶细胞的活动比其他签名组合得分较长生存。研究人员证实低TCF7 /高溶细胞的活动评分之间的关系在其他肿瘤类型,包括肾脏癌,食管癌,神经胶质瘤,肉瘤和肺癌症。此外,研究人员确定,TCF7签名可以预测病人结果独立于其他变量。
“虽然需要执行额外的研究,这些分析表明,通过tumor-based表达式甲基化定量特征筛选,确定immunoepignomic状态可以让病人的准确预测的结果。打开发现潜在的新目标个性化的治疗决定。它类似于指纹或虹膜扫描,刊登在杂志上的封面,“雪峰王博士说,准会员部的生物统计学和生物信息学和计算在莫菲特免疫学。
