2020年芬兰的冠状病毒疫情始于五种病毒谱系

2020年芬兰的冠状病毒疫情始于五种病毒谱系
芬兰2020年新冠肺炎每周统计数据及总体时间表。图(a)显示了基于芬兰卫生和福利研究所(THL)的COVID-19传染病登记处的PCR检测数量(总n = 967,885)和阳性结果(总n = 21,731)。线的颜色与其各自的轴相匹配,即表示检测数量的轴为右,表示阳性病例数的轴为左。图(b)显示了提交给GISAID的SARS-CoV-2序列的数量(总数n = 1,597)。图(c)描述了SARS-CoV-2到达芬兰的总体时间表,以及芬兰政府和卫生当局随后采取的应对措施,在图(a)和(b)中以字母a - j表示。括号内列出了每次应对措施的确切日期。这些信息是基于THL的公共记录。赫尔辛基和乌西马医院区。信贷:通信医学(2022)。DOI: 10.1038 / s43856 - 022 - 00130 - 7

COVID-19大流行于2019年底在中国武汉开始。从那时起,尽管人们试图限制SARS-CoV-2病毒,但它仍在迅速传播。截至2022年4月中旬,全球报告的冠状病毒感染病例数超过5亿例,死亡总人数超过620万。

来自赫尔辛基大学和比利时鲁汶大学的研究人员调查了2020年SARS-CoV-2在芬兰的到来和传播。据分析,共有42个独立在2020年春天到达芬兰的血统中,只有少数人引起了大规模的连锁反应.研究结果发表在通信医学日报》。

“对冠状病毒地理进化史的研究显示,在2020年春天,估计有42种独立的病毒谱系主要来自意大利、奥地利和西班牙。其中四种病毒谱系导致了2020年春季芬兰三分之二的疫情,而来自西班牙的一种病毒谱系导致了一条主要的传播链,覆盖了该国三分之一的疫情。然而,42个谱系中的大多数并没有导致芬兰的社区传播,”博士后研究员Ravi Kant说。

“在大流行的早期阶段,监测传播链的最大问题之一是病毒在世界各地的遗传相似性——基因上的差异很小之间的以及传播链。菲利普·勒梅(Philippe Lemey)的研究小组开发了一种分析技术,将数据与在个体和群体水平上对病毒基因组进行序列分析。我们将这项技术应用于芬兰的测序数据,”博士后研究员Teemu Smura说。

冠状病毒从奥地利、意大利和西班牙登陆芬兰

据研究人员称,奥地利、西班牙和意大利是2020年冠状病毒传播到芬兰的最重要来源。这些国家在2020年2月也出现了最早的感染高峰。

“冠状病毒感染的一个可能来源是来自奥地利的旅行者,他们可能在受欢迎的滑雪胜地感染了这种病毒。至少在奥地利蒂罗尔的伊斯切尔镇,2020年3月的冠状病毒疫情很严重。从那里传播的病毒株可能是一些欧洲国家传播链的背后,”博士研究员Phuoc Truong Nguyen说。

“我们的研究结果表明,只有一小部分感染会进一步传播,这表明如果及早采取检疫、检测、追踪和隔离计划或其他边境控制措施,可以延缓感染病例在社会中广泛传播链的发展。然而,这些措施只有与其他措施相结合才能有效如果要预防的病毒株尚未传播,”Olli Vapalahti教授说。

SARS-CoV-2已经进化成一种复杂的病毒

与冠状病毒大流行有关的关键问题与病毒的持续演变有关。最初,SARS-CoV-2作为一种人畜共患(动物与人类之间传播)疾病传播给人类,最有可能来自蝙蝠。

“病毒在新宿主物种中的循环需要许多变化:例如,病毒必须调整其表面蛋白质,使它们更有效地附着在宿主细胞上。此外,病毒必须克服宿主的先天防御。事实上,冠状病毒在大量人群中的快速传播已经使病毒产生了复杂的遗传多样性。目前,相关研究中最核心的问题之一是这些不同的变化如何改变病毒的生物学特性,以及选择压力在未来引导病毒走向什么样的变化,”Tarja Sironen副教授说。

2020年芬兰的流行病浪潮

  • 芬兰于2020年1月29日在一名来自中国武汉的游客身上诊断出首例SARS-CoV-2病例。然而,这种感染并没有传染给芬兰的其他人。
  • 芬兰的第一波疫情始于2020年2月底,5月初达到高峰,6月初结束。
  • 6月和7月,芬兰的冠状病毒发病率较低。
  • 第二波疫情始于2020年8月,一直持续到11月初。

更多信息:Phuoc Truong Nguyen等人,2020年芬兰SARS-CoV-2的系统动力学,通信医学(2022)。DOI: 10.1038 / s43856 - 022 - 00130 - 7

所提供的赫尔辛基大学
引用芬兰2020年冠状病毒疫情始于2023年4月20日从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-06-coronavirus-epidemic-finland-began-virus.html检索到的五个病毒谱系(2022年,6月14日)
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