癫痫基因的遗传变异被发现

癫痫
图片来源:Pixabay/CC0 Public Domain

根据发表在《西北医学》杂志上的一项研究,研究人员发现了一种新方法,可以确定癫痫相关基因SZT2的个体遗传变异是否会导致神经发育障碍大脑

SZT2的致病变异与不同神经发育障碍的发展有关,包括早发性癫痫和发育迟缓。此外,SZT2蛋白在mTORC1信号通路中起着重要作用,有助于促进和扩散。

同时,许多SZT2错义变体——其中a被另一种基因所取代——越来越多地通过临床基因检测被发现,但被归类为意义不确定的变异,或与疾病没有明确关联的变异。

然而,将这些变异分类为可能的良性或致病,仍然是一个挑战,因为szt2的体积很大——它含有3400多个氨基酸——以及它缺乏晶体结构和功能域。

“有很多不同的地方这可能会发生突变,变成错义变异,所以很难区分哪些是致病的,哪些是良性的。这就是为什么像这样的高通量研究如此重要,”Gemma Carvill博士说,她是癫痫和临床神经生理学Ken and Ruth Davee神经病学部门的助理教授,也是该研究的高级作者。

在目前的研究中,Carvill的团队招募了12名携带双等位SZT2变异的个体,其中一个或多个被归类为意义不确定的变异。

利用CRISPR-Cas9基因组编辑,研究人员改造细胞以包含患者特异性的错义SZT2变体,并根据mTORC1信号通路是否活跃或不活跃来分离细胞。

研究人员随后使用新一代测序技术来确定哪些SZT2错义变异保留了功能,哪些失去了功能,并且可能具有致病性。

最终,他们发现了一种反复出现的框架内缺失——当一个氨基酸从蛋白质中缺失时——并被确定为一种功能丧失变异,并被重新归类为可能的致病性。

这种反复出现的变异也是一种创始变异,一种遗传变异,在具有相似或相同种族的个体中更普遍地发生。在这种情况下,创始人变体在德系犹太人血统的个体中更普遍,而这应该包括在对产前检查感兴趣的人的专门小组中,卡维尔说。

目前的方法也适用于其他方法根据作者的说法,它们根植于mTOR通路。

此外,mTOR抑制剂可能对影响mTOR功能的遗传变异患者有益。直到最近,与其他癫痫相关的mTOR基因相比,SZT2才与这一特定途径相关,因此需要进行未来的临床试验和高通量细胞分析。

该研究的主要作者、癫痫和临床神经生理学神经病学部门的研究助理教授Jeffrey Calhoun博士说:“在未来,我们设计试验的关键是,我们专门招募在mTOR通路基因检测中呈阳性的个体,看看这些患者是否可能从mTOR抑制中受益。”


进一步探索

研究小组确定了良性和致病基因变异之间的差异

更多信息:Jeffrey D. Calhoun等人,mTORC1功能分析揭示了SZT2功能缺失变异和框架内缺失,大脑(2022)。大脑/ awab451 DOI: 10.1093 /Academic.oup.com/brain/advance…ain/awab451/6598235?
期刊信息: 大脑

所提供的西北大学
引用:癫痫基因的遗传变异(2022,6月7日)检索于2022年8月22日从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-06-genetic-variants-epilepsy-gene.html
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