与癌症细胞系中最普遍的突变特征相关的酶

与癌症细胞系中最普遍的突变特征相关的酶
利用人类癌细胞系来研究apobec3相关突变的起源。a,用于跟踪特定时间范围内体外突变获取的实验设计。原理图是使用BioRender生成的。b,从5个细胞系和251个母克隆和子克隆的突变目录中鉴定的SBSs中提取的apobec相关标记(sig.)的概况。突变图谱绘制为胞嘧啶或胸腺嘧啶碱基全基因组取代的百分比(y轴),分类为96个可能的三核苷酸序列上下文(x轴;扩展数据图4a)。随后对COSMIC签名的反卷积显示,SBS288A对应于COSMIC参考签名SBS2, SBS288B对应于SBS13(命名为SBS13a),而SBS288E代表了COSMIC SBS13的一个新版本,命名为SBS13b,并以其提取(而不是COSMIC)形式在样本中进行了量化。全基因组泛癌症分析;WGS,全基因组测序。信贷:自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 04972 - y

一个隶属于美国和英国几家机构的研究团队发现了APOBEC3A酶与癌细胞系中最常见的突变特征之间的联系。在他们发表在杂志上的论文中自然该小组描述了从人类癌症细胞系中移除APOBEC3突变,以了解更多可能的聚集特征。

先前的研究表明,大多数癌症基因组都有突变的特征,这些特征与一种被称为APOBEC3的酶家族有关。这项研究表明,这些酶在诱变过程中发挥了作用。其他先前的研究表明,特定的酶APOBEC3B是最有可能的家族成员背后的能力变异。在这项新的研究中,研究人员仔细观察了家族中的另一个成员apobec3a,并发现证据表明它实际上是激活突变的最主要的酶。

为了进一步了解APOBEC3的可能特征,研究人员从组成细胞的细胞中去除了导致酶家族差异的突变,即APOBEC3A和APOBEC3B在多个人类细胞系样本中。他们总共与251人合作取自膀胱癌、乳腺癌或淋巴瘤患者。

研究人员随后分析了样本,以确定缺失的签名。他们发现APOBEC3A比APOBEC3B有更强的特征存在,这表明它更有可能是引发癌症突变的酶。他们还指出,他们的工作是第一个证明内生APOBEC酶是癌细胞突变特征的主要驱动因素的证据。

研究人员指出,他们的工作并没有排除APOBEC3B是突变活性的贡献者,然而,因为在一些细胞系中,APOBEC3B的缺失实际上导致了突变的增加。这一发现表明,这两种酶可能在不同的细胞中发挥不同的作用。他们承认还需要做更多的工作来发现这些作用是相互排斥的还是酶共同作用。研究人员得出结论,他们的工作也支持了20年来围绕APOBEC3酶家族所起作用的理论。


进一步探索

一类新的药物可以阻止癌症产生抗药性

更多信息:Mia Petljak等,APOBEC3在人类癌细胞中的突变机制,自然(2022)。DOI: 10.1038 / s41586 - 022 - 04972 - y
期刊信息: 自然

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引用:与癌细胞系中最常见突变特征相关的酶(2022年,7月29日)于2022年8月2日从//www.pyrotek-europe.com/news/2022-07-enzyme-linked-prevalent-mutational-signatures.html检索
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