新的基因分析技术揭示了黑色素瘤生物标志物
加州大学戴维斯分校领导的一项新的研究阐明了黑色素瘤的细胞类型特异性生物标志物或体征。这项研究最近发表在皮肤病学调查杂志．
黑色素瘤，最致命的常见皮肤癌，是可以治愈的早期诊断和治疗。然而,诊断黑素瘤在临床和显微镜下，黑素细胞痣可能会复杂化，也就是我们所知的胎记或非癌变痣。黑色素瘤的发展是一个多步骤的过程，其中“黑色素细胞”，或皮肤中含有黑色素的细胞，发生突变和增殖。在早期阶段正确识别黑色素瘤对提高生存率至关重要。
该研究的通讯作者、加州大学戴维斯分校临床皮肤病学和病理学副教授Maija Kiuru说:“黑色素瘤早期进化的生物标志物及其在肿瘤和微环境中的起源是黑色素瘤早期诊断的潜在关键。”“为了解开这个谜团，我们使用高复杂性空间RNA谱法来捕捉黑素瘤发展过程中不同细胞类型的不同基因表达模式。这种方法允许研究数百或数千个基因的表达，而不破坏肿瘤的固有结构。”
学习中使用的新技术
这项研究检查了134个黑色素细胞感兴趣区域的1000多个基因的表达，黑色素细胞是皮肤和眼睛中的一种细胞，它产生黑色素，以及邻近的角质形成细胞或免疫细胞．使用NanoString GeoMx数字空间剖面仪，检测的组织来自12个肿瘤患者的活检组织，从良性到恶性不等。
“我们发现黑色素瘤生物标志物通过特异性表达细胞类型，有些由肿瘤细胞但另一些则是由所谓的肿瘤微环境中的邻近细胞产生的。最引人注目的观察是，S100A8是一种已知的黑色素瘤标志物，被认为是由免疫细胞表达的，但它却由构成皮肤最外层的角质形成细胞表达。”Kiuru说。“过去，表皮上的黑色素瘤生物标志物在很大程度上被忽视了。”
角质化细胞表皮细胞它们有多种功能，包括形成阻挡微生物、热量、水分流失和紫外线辐射的屏障。正常的角质形成细胞也控制黑素细胞的生长。
“出乎意料的是，我们发现S100A8在黑色素瘤生长过程中由肿瘤微环境中的角质形成细胞表达，”Kiuru说。“我们进一步观察了S100A8在252个良性和恶性黑色素细胞肿瘤中的表达，结果显示明显角化细胞-来源的S100A8在黑色素瘤中表达，而在良性肿瘤．这表明S100A8在表皮中的表达可能是黑色素瘤发展的一个容易检测的指标。”
黑色素瘤的诊断和预后的许多分子检测正逐渐被引入，但黑色素瘤早期发展的标记物，特别是在肿瘤微环境,仍然缺乏。此外，尽管自免疫检查点抑制剂疗法发展以来，转移性黑色素瘤的治疗发生了巨大变化，但预测患者无癌持续时间的生物标志物在很大程度上尚不清楚。此前的研究使用了复杂的方法，包括单细胞RNA测序，但主要集中在黑色素瘤转移或继发性肿瘤生长。这忽略了原发性黑色素瘤的角质形成细胞微环境。
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