卵巢后的肺部疾病与其他疤痕疾病的起源

卵巢后的肺部疾病与其他疤痕疾病的起源
研究设计:Covid-19-19肺疾病的人工智能引导的导航。(从上到下)步骤0:使用称为布尔等效相关群集(BECC133)的机器学习工具(BECC133)挖掘了超过45,000人,小鼠和大鼠基因表达数据库,以识别不变的宿主对病毒大流传学(VIP)的反应。在没有足够数量的COVID-19数据集中,在COVID-19大流行病开始时,这些VIP签名仅在过去的大流行中的两个数据集上进行了培训(流感和禽流感; GSE47963,GSE47963,n = 438;GSE113211,n = 118),没有进一步训练来预期分析当前大流行的样品(即Covid-19; n = 727个来自不同数据集的样品)。20代分类疾病严重程度的子集称为严重VIP(SVIP)签名。VIP签名似乎捕获了“不变”的宿主反应,即所有病毒大流行病引起的宿主免疫反应的共同基本性质,包括COVID-19。步骤1:对代表大量肺部疾病的多种转录组数据集进行了分析的VIP/SVIP特征和COV-LUNG特定13基因特征。这些努力确定COVID-19肺疾病是最接近特发性肺纤维化(IPF)的肺部疾病。两种条件都诱导了一系列基因特征。步骤2:先前在IPF27中验证的临床上有用的全血和PBMC衍生的预后特征显示在Covid-19中显示了交叉疗效,反之亦然。 Step 3: Gene signatures of alveolar type II (AT2) cytopathic changes that are known to fuel IPF were analyzed in COVID-19 lung, and predicted shared features were validated in human and hamster lungs and lung-organoid derived models. Step 4: Protein- protein interaction (PPI) network built using sViP and AT2 cytopathy-related signatures was analyzed to pinpoint ER stress as a major shared feature in COVID-19 lung disease and IPF, which was subsequently validated in human and hamster lungs. Credit:ebiomedicine(2022)。doi:10.1016/j.ebiom.2022.104185

虽然大多数人在一两周内从Covid-19中恢复过来,但多达三分之一的幸存者经历了初次感染后数周和几个月的持续或新症状。

一种“长卷”的形式是(ILD),一组具有炎症和疤痕(纤维化)为特征的慢性肺部疾病,使肺部难以获得足够的氧气。目前,从诊断到预后再到管理,目前知之甚少。以最严重的形式,这种疾病是致命的

在一项新研究中,发表于2022年7月20日在线发行ebiomedicine,加州大学圣地亚哥分校的研究人员为驱动ILD的基本细胞病理提供了第一个见解。

“使用(AI)方法,我们发现由Covid-19引起的类似(IPF)是ILD的最常见和最致命的ILD,”联合研究作者说,加州大学圣地亚哥分校医学学院医学和蜂窝医学系教授Pradipta Ghosh医学博士Pradipta Ghosh说。,两个条件显示相似肺和血液中的模式,以及肺泡II型(AT2)细胞内的功能失调过程。”

AT2细胞在肺功能中起多个关键作用,包括肺表面活性剂的产生,该肺表面活性剂可防止肺部细胞在受伤后呼出和肺部细胞再生后塌陷。

Ghosh说:“这些发现是有见地的,因为众所周知,AT2细胞包含一个应对压力,内部或外部的优雅质量控制网络。”“质量控制的失败会导致更广泛的器官功能障碍,在这种情况下,肺部的纤维化重塑。”

为了进行他们的研究,Ghosh与加州大学圣地亚哥分校计算机科学,工程和儿科的副教授与联合院士作者Debashis Sahoo合作,以访问跨学科方法,例如AI-AI-ASSCAINT的“大数据”bob电竞分析。

戈什(Ghosh)和萨胡(Sahoo)表示,这种方法将帮助他们保持公正,以导致新兴的,大流行疾病的未知数。他们分析了与各种肺部条件相关的1000多个人类肺转录组数据集,特别是寻找基因表达模式,炎症信号传导和细胞变化。最接近匹配的疾病:IPF。

作者能够成功地诱导人类肺器官中的这些讲述元素,在Covid-19的仓鼠模型中,并可以证实它们在Covid-19的死者肺中的存在。使用抗SARS-COV-2治疗剂在仓鼠中也逆转了关键元素。更深入的分析将内质网胁迫定位为后腔后肺和ILD的共同早期触发。

戈什说,使用计算模型来识别共享基因表达和在Covid-19和IPF之间,我们的发现超出了当前大流行。

“这里确定的见解,生物标志物,工具,机制和有前途的治疗途径可能会刺激针对IPF和其他纤维化间质性肺部疾病患者的疗法开发,所有这些肺部疾病的患者都有有限或没有治疗方案。”

IPF在美国影响约100,000人,每年有30,000至40,000个新案件。该疾病的预后较差,自诊断后的平均存活率估计为2至5年。


进一步探索

在实验室菜肴中生长的人类迷你肺最接近真实的东西

更多信息:Saptarshi Sinha等人,Covid-19肺疾病与特发性肺纤维化的驱动器AT2细胞疗法特征,ebiomedicine(2022)。doi:10.1016/j.ebiom.2022.104185
期刊信息: ebiomedicine

引用:Covid肺部疾病的起源与其他疤痕疾病(2022年7月20日)2022年7月21日从//www.pyrotek-europe.com/news/news/2022-07-post-covid-covid-lung-disease-scarring-disorders检索。html
本文件受版权保护。除了出于私人研究或研究目的的任何公平交易之外,未经书面许可,不得复制任何部分。内容仅供参考。
72分享

对编辑的反馈